在抗战初期,共产党提出的全民抗战主张,得到全国人民的拥护,国民党也提出“地不分南北,人无论老幼,全民抗战,焦土抗战”的口号,答应与共产党合作抗日,于是以国共合作为基础的抗日民族统一战线形成。1939年1月,周胜芳所率山东省保安独立第八旅遭日军进攻弃离县城后,在安柴、鲁崔、河东、院庄等村驻防。1939年秋,驻博兴县城的日军100余人进犯国民党周胜芳部傅相坤团特务营驻地鲁崔村(今属湖滨镇),营长曹子成率部抵抗,粉碎日军多次进攻,击毙日军官1名、士兵10余名,特务营伤亡10余人。10月22日,日军200多人第二次进犯鲁崔,进了埋设地雷的墓地周围,结果被炸得死伤惨重,不到傍晚就撤退而去。院庄惨案正是在继鲁崔两战之后,日军带有报复性的一次恶战。
1939年11月,驻院庄武装部队在村东北角墓地里埋设地雷炸死一率军偷袭的日军小官。日军侵袭未成十分恼火,再加上有人员伤亡更是气急败坏,于是组织部队攻打院庄。
11月29日,日军从广饶、高苑、青城等地纠集300多人,从见桥(今湖滨镇柳舒村)下车,攻克河东防线,并给河东村群众造成重大人员和财产损失后,又向院庄发起猛攻。周胜芳部队三营营长李春沛率部队在老百姓的配合下,奋力抵抗,双方激战一夜,互有伤亡。次日,三营大部退入麻大湖,固守村东北角焦家沟的周胜芳部刘兰洲连70余人孤军奋战,全部牺牲,日军20余人毙命。
院庄被攻克,日军进入村后,见人就杀,见物就抢,见屋就烧,整个村庄成为一片焦土。12月2日,穷凶极恶的日军再次返回院庄,村中大部分士兵和村民已躲入村西芦苇丛中,部分群众藏在村边草垛和水泊屋子里,少数老幼病残没来得及躲藏,惨遭日军杀害。日军见到村民追上去就用刀捅死或者开枪打死。焦云堂之母抱着不满周岁的婴儿逃生时,后面紧跟着日军追赶,为了不连累乡亲,她狠心将亲生骨肉投入冰窟中。焦兆功之母携带一双儿女逃生时被日军打死,倒下后不懂事的孩子仍爬在她身上吃奶。日军对躲藏在村边柴草垛里的村民也不放过,点火将他们活活烧死。日军惨无人道的暴行令人发指。
日军侵入院庄及附近村中,残杀村民100多人(其中院庄村46人,河东村40人),上有七八十岁的老人,下有未出生的胎儿,烧毁房屋1047间,抢走大牲畜11头,抢走大量钱、粮、车具、衣、布、被褥等物品,造成经济损失321.86万元,犯下了不可饶恕的罪行。