驕傲!江蘇"超牛"博士,研究成果引起強烈反響,獲美國科學院院士推介!

2018年12月17日,中國團隊在國際頂級學術期刊《Nature Plants》上發表了一篇題為《Liriodendron genome sheds light on angiosperm phylogeny and species-pair differentiation》的論文,在全球首次破譯鵝掌楸基因組。該團隊由

南京林業大學施季森教授領銜,團隊郝兆東博士為該研究論文的共同第一作者。

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郝兆東博士在南京林業大學求學十年,曾獲得過國家研究生一等獎學金、南林校長一等獎學金等多項獎勵,發表過SCI論文十餘篇。

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南林十年,他不斷挑戰自己

2010年,家鄉在江蘇興化的郝兆東考取南京林業大學林學院,就讀生物技術專業。初入高校的他也曾迷茫困惑,但是學院老師們的諄諄教誨和淵博的知識幫他拂去了青澀,帶他邁進了科研的大門。

2014年,郝兆東開始攻讀碩士學位,又選拔為林木遺傳育種碩博連讀研究生。如何完成從本科階段的被動學習,轉型到研究生階段的學術型主動學習,是擺在郝兆東面前的一道門檻。

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郝兆東爬樹採集樣本

在導師施季森教授的建議下,郝兆東開始堅持每天研讀各類學術論文,認真研究每篇論文的研究方法與創新之處,並經常與同學分享。為更好的記錄並分享研讀心得,2017年5月,微信公眾號《植物類SCI摘要》在導師的鼓勵和支持下,成功上線。此後的一千多個日子裡,郝兆東不跟熱點、不關心閱讀量、不關心訂閱人數,就這樣每天一篇,1000多天如一日的堅持下來,積累起來,從未中斷。郝兆東說,"對於每一個人來說,每天86400秒時間都是公平同享的。但如何提高單位時間利用效率和用好零星時間是值得好好規劃的。俗話說'時間是海綿裡的水,只要擠總是有的'並非絕對,但讓流淌著的絕對單位時間增值,是可以做到的"。

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2020年3月11日,在我國植物科研學術圈有重要影響的《植物科學最前沿》公眾號,推出了一篇題為《這是植物科研圈一個令人欽佩的真人真事,發給你,共勉!——來挑戰每天一篇文獻活動》的專評,對微信公眾號《植物科學SCI摘要》"挑戰每天一篇文獻活動"的真人真事進行了詳細報道和高度評價,而這背後的挑戰發起人正是林木遺傳育種博士研究生郝兆東。

"有時需要閱讀數篇論文才能選出一篇可供分享的內容。"郝兆東介紹,"這就是一種讓自己走出'舒適圈'的機制,挑戰自己的惰性,也讓自己獲得提升。"

"如燕、如蟻、如蜂般,一天不落的辛勤筆耕;尤如'春種一粒粟'般伊始,更期'秋收萬顆子'的豐碩。"郝兆東的導師施季森教授在《植物類SCI摘要》微信公眾號上線1000天時,這樣為他點贊。

厚積薄發,研究成果在業內引起強烈反響

由於有長期堅持閱讀和評述國際前沿重要文獻的積累,以及較為系統的生物信息學理論與實踐培訓,並且掌握熟練的生物信息大數據挖掘計算機編程技術。2016開始郝兆東加入到南京林業大學和華大基因研究院合作的"中國1000種植物基因組計劃"——解碼木蘭類植物代表種"鵝掌楸基因組"項目,成為項目主要完成人之一。之後,南林施季森、陳金慧教授領銜的團隊在國際頂級學術期刊《Nature Plants》上在線發表題為《Liriodendron genome sheds light on angiosperm phylogeny and species-pair differentiation》的論文,首次揭示了木蘭類物種鵝掌楸複雜基因組的高質量組裝,從全基因組水平解析被子植物的系統演化,確定了以鵝掌楸為代表的木蘭類植物在被子植物中的演化地位,郝兆東博士為該研究論文的共同第一作者,這也是他涉足該研究領域後取得的又一項重要成果。

而在數年前,生物信息學對於郝兆東而言還是個全新的領域。

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2015年,在導師施季森教授的指導下,郝兆東開始涉足生物學科前沿領域——生物信息學,為林木基因組的破譯工作做準備。在施季森和陳金慧教授的指導下,郝兆東用三個多月的時間,利用二代基因測序與生物信息學技術,破譯了水杉葉綠體基因組。之後,郝兆東在植物葉綠體基因組方面的工作不斷取得新的進展,碩士階段還破譯了另一重要孑遺裸子植物水松的葉綠體基因組,成功解析了針葉樹種葉綠體基因組結構與基因組重排之間的演化關係。

2017年,鵝掌楸基因組研究項目,在施季森教授、陳金慧教授的推動下,進入最後的衝刺階段,郝兆東被派駐深圳,對接華大基因研究院,跟蹤鵝掌楸基因組的數據質量和生物信息分析進度,他逐漸融入到華大的鵝掌楸基因組項目團隊,成為生物信息分析的核心成員之一。功夫不負有心人,項目組的鵝掌楸基因組研究成果一經問世,迅速在業內引起強烈反響。《Nature Plants》在同期刊發了美國科學院院士Douglas E. Soltis和Pamela Soltis夫婦為鵝掌楸基因組論文發表所作評論和推介。鵝掌楸基因組的文章,還被Web of Sci 和Nature Plants 推選為2019年有重要影響的亮點文章。

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2019年2月,郝兆東獲得南京林業大學公派資助,前往世界一流大學荷蘭瓦赫寧根大學及研究中心(Wageningen University & Research)的生物化學實驗室進行為期一年的研修。談及未來,郝兆東說:"南林的科研沃土滋養了我,我感懷終身;生物信息學和林木基因組研究領域大有可為,我將繼續一步一個腳印走下去!"

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素材來源:南京林業大學官微


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