CRISPR基因編輯技術使得科學家們能夠更加高效地對基因進行編輯，由於癌症的發生伴隨著大量DNA突變的積累，該技術曾多次被利用進行癌症研究。
加州大學聖地亞哥醫學院(University of California San Diego School of Medicine)和摩爾斯癌症中心(Moores Cancer Center)的一組研究人員利用CRISPR技術識別出了慢性髓系白血病的關鍵調節因子。這是一種很難治療的癌症，以復發頻繁為特徵。
“我們使用CRISPR技術在白血病細胞中進行全基因組篩選，一次阻斷數千個基因。這是一個非常強大的工具，它使我們能夠識別大量促進白血病生長的基因，並發現可以針對這種疾病的新弱點，”藥理學和醫學系教授、資深作者Tannishtha Reya博士說。
“這項研究還首次表明，整個基因組基於CRISPR的篩選實際上可以以一種更具有生理學相關性的方式進行:使用原發癌細胞，並在本地微環境的環境中進行。”
Reya和他的同事在2020年4月20日的《Nature Cancer》雜誌網絡版上發表的報告中指出，RNA結合蛋白是維持和保護耐藥白血病幹細胞的一類關鍵蛋白。RNA結合蛋白通常控制著細胞如何、何時以及是否產生某些蛋白質。
作者重點研究了Staufen2 (Stau2)，它是RNA結合蛋白家族中一個相對未被研究的成員，以前只知道它控制大腦和神經系統的發育。
該研究主要作者為Jeevisha Bajaj博士，當時她是加州大學聖地亞哥分校Reya實驗室的博士後。
該團隊開發了一個小鼠模型，在該模型中，Stau2基因被刪除，發現該蛋白的丟失導致白血病生長和繁殖大幅減少，並顯著提高了小鼠模型的整體存活率。
白血病患者的原代組織樣本的持續生長也需要Stau2，這表明在人類疾病中存在一種保守的依賴性。
“我們對這項工作特別興奮，因為據我們所知，這是第一次證明Staufen2是任何癌症的關鍵依賴，”Reya說。
為了瞭解Stau2是如何控制癌症的，研究人員通過RNA-Seq和eCLIP-Seq對其靶標進行了基因組級的計算分析。
這導致研究人員發現了該蛋白控制關鍵的致癌基因(如Ras)和表觀遺傳調控因子(如LSD/KDM蛋白家族)，後者是正在測試的針對白血病和其他癌症的關鍵藥物靶點。
這些發現對急性髓細胞白血病(AML)和其他血癌也有意義。
Bajaj說:“這項工作對於發現新的治療方法將特別重要。”
“我們的全基因組篩選發現了對癌症生長至關重要的細胞信號，在未來，這項研究將有助於研究微環境，即腫瘤周圍的區域，包括組織、血管和與癌症行為相關的重要分子信號。”
編譯/前瞻經濟學人APP資訊組
原文來源：
https://www.sciencedaily.com/releases/2020/04/200420125543.htm
