深化醫保支付方式改革是城鄉居民基本醫療保險民生工程實施的一項主要任務，為完善政策措施，蒙城縣醫保局擴大按病種付費病種，制定按床日付費結算管理辦法，繼續深化醫保支付方式改革，最大程度地惠及參保城鄉居民。
擴大按病種付費政策。2019年全縣醫療機構共執行按病種付費病種207種，12月5日起按照市醫保局、衛健委《關於新增50個病種執行按病種付費工作的通知》，執行按病種付費病種257種，執行率61.43%，2019年1-12月共補償76391人次，醫藥費總額39592.35萬元，基金支付31188.84萬元。
實行按床日付費結算管理。2019年7月23日醫保局出臺《關於重性精神病按床日付費試點工作的通知》，試行按床日付費制度，在符合條件的腦康醫院先行試點。截至12月底，蒙城縣腦康醫院(二級精神病專科醫院)按床日付費出院患者392人，醫保局定額結算金額為330.2萬元，腦康醫院實際支付患者金額332.52萬元；2019年8月至12月實行按床日付費制度以來，該院住院人次由2018年的1177人下降到2019年的918人次，同比下降22.01%，住院次均費用由8320元下降到7558元，同比下降9.16%。
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