大牙
日本人并不是唯独不敢动孔庙，事实上，也没动北京的故宫和其他皇室宗庙、园林。原因有如下三个：
一、安抚人心
七七事变后，在日寇的最后通牒下，7月28日，宋哲元的29军撤出北平，日寇进驻了这个不设防的文化古都，几乎与此同时，日寇扶植汉奸江朝宗为主席的“北平地方治安维持会”，用以维持地方治安。
这段期间，为了安抚人心、分化瓦解潜在的抵抗势力、骗取国际同情，日本人必须做足表面文章，所以，日寇始终没有骚扰故宫，甚至还在1938年3月6日，专门在北平孔庙举办了高规格的祭孔仪式。
二、日本学者的建议
侵华战争打响后，日本学者多次向日本军部提出保护中国文化古迹的建议，其中最有名的东京大学的高田真治教授，日寇进犯山东时，他提出：“山东作战，如破坏曲阜古迹，日本将负破坏世界文化遗迹的责任。“
自1938年1月，日寇进入曲阜后，不仅派兵驻守孔庙，还组织官兵实施参拜活动。在整个侵华战争时期内，曲阜“三孔”得以保全。
三、孔子的声望
孔子是儒家学派创始人，在世界范围内也享有崇高声望，儒家学说不仅影响中国王朝两千年，儒家的理论在历史上也对日本产生过重要影响，虽然被“魔改”，但不可否认，日本本土的神道教也无法摆脱其中的一些观点主张。日寇官兵从内心深处，也对孔子有着敬畏之心，并未夸大之词。
结尾说句题外话，所谓“因果循环、报应不爽”，虽然老天经常会爽约不尽职，但在日寇保护中国文化这一点，还真是起到作用了，美军准备投放原子弹时，本来京都也是很棒的一个选项，正是由于陆军部长亨利·刘易斯·史汀生出于同样原因（求放过梁思成，他不具备这实力）的坚持，才逃过原爆之劫。
历来现实
意识形态这东西真是无处不在，日本人想侵略中国，对中国造成很大的伤害，于是日本人就不在是人，而是禽兽，他们的一切行为，不管是好的还是坏的都要谴责。坏的是其本性，好的事假装伪善。所有属于日本的都要反对，这就叫意识形态。
日本人也是人，而且是个很优秀的民族，否则也不会以弹丸之地侵略我泱泱大国，日本有很多东西值得我们借鉴和学习，日本曾经远比我们落后很多，但通过明治维新，立刻立于世界强国之林。二战战败，全国遭受了近似破坏性的打击，但是仅仅几十年，他们就成为亚洲四小龙之首，世界第二大经济体。日本给我们的除了苦难以外还有教训，让我们知道夜郎自大只是自欺欺人，我们应该吸取教训，抬头看看别人是怎么发展的，而不是把一切归为别人的邪恶，怨天尤人，把自己的软弱归罪于别人的强横。人类社会也遵循自然法则，弱肉强食，永远不要企图用谴责让别人而制止侵略的脚步，强大才是硬道理。
日本能够发展的好，是因为他们善于学习，民族团结，对孔子的尊重也绝非做做样子，即便是在日本国内，对孔子的崇拜也比我们差的不是很多。日本军队崇拜孔子也是民族特性之一。即便是到现在，日本人的尊孔思想依然盛行。井上靖，为了追踪《论语》的成书过程，先后六次踏寻孔子的足迹，以八旬高龄完成《孔子》这部书，了却他的夙愿。该书出版后列为１９８９年日本文艺类十大畅销书之首，并获野间奖。
如果祭拜孔庙时做样子，那这个呢，没有仪式、没有关注，日本军官在祭拜孔子，他在给谁看？
不能正确客观的认识事物是非常危险的，要想不被日本人欺负，就要深刻地去了解日本人，了解日本文化，看看他们是怎么认识事物，是怎样发展壮大的，找到问题的根源才是解决问题第一步。日本人的很多民族特性是值得我们反思学习的，一味的凭着民族情绪去咒诅和谩骂，而不去寻找问题的根源，不从根本上解决被欺负的根本问题，我们将迎来新一轮屈辱。
就以现在的形式而言，日本国内的反战情绪也非常高，军国主义思想在日本国内也有很多的反对者，我们应该看到这种矛盾，利用这种矛盾，努力团结反军国主义的日本政党和人士，打击日本军国主义思想，分裂日本，而不是把整个日本视若洪水猛兽，把那些反对侵华战争的日本开明人士逼到敌对阵营里。逢日必反，所有日本人都没有人性，他们的一切行为除了邪恶的就是假冒伪善，你觉得这真的客观吗？
山野论史
北平和孔子老家山东的孔庙日军不仅没有像对待中国其他地方一样杀烧抢掠，反而对这两处孔庙恭恭敬敬，在山东孔庙沦陷期间，日军不仅没有对孔庙进行大规模破坏反而保护的很好，很多日军还进里面去捐钱。
日军明明残暴无比，对中国许多地方都谁三光政策，为何单独对孔庙崇拜又加。其实日军也只是对这两处的孔庙不那么放肆，这里有高层的命令要求。而且日军对孔家也十分尊敬，这里日军纪律非常好，还会帮着扫大街，修复孔庙。
日本对待孔庙表面的里面是为了安抚人心，虽然当时民国政府成立好多年，但是封建思想依旧深入人心。需要利用孔子后入的名望来招抚人心。另外日本也受中国儒家思想的影响也对孔子十分尊重。但是日本人的所做所为却违背孔子的仁义与道德。
日军对其他孔庙却不这么礼貌。日军把腾冲文庙中位于大成殿后面的启圣宫，也就是供奉孔子父母的地方，改造成专供军官淫乐的“慰安所”，后将其焚毁。其实对孔庙也没有那么客气，日军后来又掘盗曲阜周公庙文物，运往日本。
泰瑞坊
日本人不动孔庙是因为孔子也是日本人的先贤前圣，日本的文化传承也是儒家文化。唐之影子在日本，明之影子在朝鲜，日本以小中华自居，所以他们不动孔庙！
日本帝国主义从明朝开始就策划侵占中国，清朝晚期更是策划全面侵华。这里的全面侵华不仅仅是要侵占所有的中国领土，控制中国的经济与政治，更要在文化上全面侵占中国，让中国人从思想上永远服从日本的领导！
日本为何自称小中华呢？为何要以儒家正宗自居呢？其目的就是想彻彻底底的全面占有中国。因此日本侵占北平后，积极策划祭奠孔子，目的就是向中国的读书人宣示他们也是孔子文化的传承人，跟我们中国一样尊师重道，以此来削弱中国人抗日的意志！
大秦铁鹰剑士
为何不动孔庙？因为有野心呗，想统治中华大地而已。孔儒之道在中国延续了两千年，是各朝各代统治的基础，不变之本，哪怕来自漠北大草原的游牧民族蒙元和来自东北林海雪原的满清都不例外，何况受中华文明影响两千年的日本？
中华文明能够延续下来，不能不说没有孔家的功劳。中华文明背后是儒家，儒家是一面大旗，孔家就是执手这面旗帜的旗手。旗帜下是一道洪流，洪流中是儒家为代表的诸子百家。孔家在，旗帜就在，旗帜在，各路人马就有目标和信心延续下去。没有孔家这个世家传承，文明延续就可能是个问题，要不，四大文明古国，为何只有中国存在？
树大了，就容易招风，因为根深枝茂，就成为各方拉拢的对象，同时也因为家大业大，责任重大，来不得半点闪失。与各朝各代的合作并存，这也是孔家落人嘴舌之处。可是，孔家不这样做，怎么能传承文化？就拿元朝来说选择对抗，那汉字会不会被中断？历史有时就是这么残酷。远的不说，就看看新疆，谁知道千年前新疆最盛行的是佛教？
所以，每一个外来者如果有野心统治当地，都会对当地的宗教和名门望族加以利用，安抚人心，以有利于自己政权建立，除非对抗到非暴力解决。来个杀鸡给猴看，威慑一片。所以日本不会动孔庙，否则就不会挟持末代皇帝建立满洲国了。毕竟，蒙元是教训，满清是经验，何况研究透了中国的日本？
地平线e时代
针对此事日军当年祭拜北平孔庙之事，我在2013年旅游的时候问过孔庙中的工作人员。这位朋友告诉我，他说在日本人的文化中，儒家思想和孔子是非常敬仰和尊重的，他们很认为孔孟二位圣人是东方最伟大的学者。当时很多百姓听闻日军要轰炸，然后逃到这里，祈求避过一劫。确实日本人没有对这里进行任何破坏，不止是北平孔庙，针对曲阜的“三孔”也是保护有加，并且派宪兵专门站岗执勤，以防有士兵进入破坏。鬼子虽坏，但是这一点还是值得肯定的 。
当年侵华期间，有日本的学者教授上书军部，要求保护中国的一些文化古迹，其中就有三孔和孟府，岳王庙和岳庙等等。这些地方日军果然没有破坏，而且在轰炸的时候，刻意绕来。
纵观一场侵华战争，日本破坏的中国文物遗迹何止千千万，日本不可能良心发现，怕担负上破坏世界文化古迹的责任。
这些家伙确确实实是对孔子的文化和传统儒学相当尊重，以至于现在每年还要在日本举行祭祀孔孟的活动。面对孔子的塑像和灵位，小鬼子也有敬畏之心。
可惜啊，许多年后，三孔还是被砸了个稀巴烂，好歹没一把火给烧掉，总算留下了点东西给后人。
大狮
日寇不砸孔庙很正常，脑子进水才砸孔庙。
孔子的思想对于维护统治可是大大滴有效！两千年来无论是改朝换代，还是外敌入侵，孔府、孔庙可都是最“识时务”的一批人。 他们只想跪皇帝，帮上层统治下层，至于谁当皇帝，谁来统治中国都没关系，有奶便是娘嘛~
（关于“孔府”的“光荣历史”我以前写过3次了，现在截几张图，有兴趣的可以去我主页找全文看）
日本鬼子打到中国来是想当上等人，让中国人当亡国奴的。那么孔子这种“君君臣臣，父父子子”的等级思想便是再好不过的统治工具了。鬼子脑子进水才会去砸它呢！
也就只有“新文化运动”和某个时期，为了推行“民主”、“平等”才会喊出“打倒孔家店”的口号。
但是现在，在弘扬传统文化的旗号下，一些传统文化的糟粕又从垃圾堆里被翻出来供奉。
今天的人，可不要跪了几千年，好不容易站了起来，又被人忽悠的跪下了
福林说历史
不是不敢动，因为动了就会遭到中国文人的大量口诛笔伐，笔杆子可比枪杆子厉害多了，杀人于无形！日本人祭拜孔子，就是为了收买人心，因为中国自古就是儒家文化，中国自古的统治阶级都用孔子的儒家思想来统治百姓，日寇祭拜孔子也就是学中国统治者在思想上收买人心，达到以文化政府中国，以思想侵略中国的目的。
大鱼工作室
日本人在整个侵华战争中，毁掉了中国很多的地方，但是唯独山东孔庙、还有北京故宫及皇室宗庙不敢动。
为什么侵华日军不动这几个地方呢？我想原因有以下三点：
第一：日军不敢动孔庙，是因为孔子在中国人心中，代表着一种精神信仰，一旦日本人破坏了孔庙，那么日本就算占领中国，也会给自己制造麻烦。
还有一层原因就是日本人受到的儒家思想影响深远，从唐朝派来的遣唐使开始，一直学习中国的文化。
第二：在日军侵华之前，日本很多学者就明确表示不能动孔庙及一些特别有代表性的建筑，一旦破坏，将会造成毁灭性打击。
更为严重的是日本将要承担毁坏世界文化遗产的罪责。
第三：日军非但不敢动这些地方，还专门负责保护及维护孔庙。很大一部分就是作秀，给那些为自己服务的汉奸们看的。
林间野史
我是萨沙，我来回答。
这是日本人聪明的地方。
日本人不但没敢动孔庙这类，连孙中山陵墓也没敢破坏。甚至部分抗战陵墓，日军也只是部分破坏。
这种行为容易引起公愤，导致占领区人民的普遍反抗。历史上这种事情并不少！
田单齐国将领田单诱使燕军行暴，派人散布谣言，说害怕燕军刨了齐国人城外的祖坟。有勇无谋的骑劫听到谣言后居然上当了，他派兵去把燕国先祖的坟墓都挖开，并把尸骨堆起来焚烧。 齐国人在城上看到后，恨得咬牙切齿，誓死与燕军决一死战。最终，田单采用诈降的方法，全歼齐军，尽复失地70余城，大败敌人。
其实不要说日本人，所有侵略者都是如此。
英国人在印度，强迫印度教徒和穆斯林用嘴咬开带有猪油和牛油的子弹壳，导致印度土兵大暴动。
日本兵在占领河北省，哪里有不少回民的村子。日本兵在村子里面抢劫，事后还放火烧毁了清真寺。一些日本兵则驻扎在清真寺里面，大吃猪肉，还将猪骨头扔到回民的水井中。
这下回民都怒了，组成了回民支队抗日。
