朱由檢繼位之時，只有16歲，面對千瘡百孔的大明，以及那位與他只差了100歲的九千九百歲魏忠賢，其做出了錯誤的政治判斷。
由於魏忠賢性格殘忍陰毒，執掌朝政後，排除異己，甚至假傳聖旨，謀害皇嗣，將內操軍增加至一萬人，自己穿甲出入宮禁，權勢滔天，見到魏忠賢如此作為，年輕的崇禎從心底是害怕的，他怕魏忠賢學曹吉祥，試圖取而代之。
然而魏忠賢的確貪戀榮華，但並沒有曹公公那樣遠大的報復，如果他想謀害崇禎，是一件非常容易的事，宮裡大大小小的事皆被其掌控，神不知鬼不覺幹掉崇禎並非什麼難事，而以他的權勢，別人沒有真憑實據，誰又敢進行指責的？
崇禎安然無恙，說明魏忠賢不想威脅王權，在一定程度上，魏忠賢與崇禎之間是互相依存的，只是崇禎沒有意識到這個問題。
為什麼這麼說？由於明朝制度，文官集團的力量比較強大，如果是朱元璋以及朱棣這樣的帝王在位，是完全可以壓制的，然而只要皇帝能力不足，就會出現文官集團壓制皇帝的事情，很不幸，明朝朱棣以後的數代帝王能力完全不能與朱棣朱元璋相比，甚至天才的朱厚熜都不行。
於是皇帝需要分擔壓力，那麼閹黨誕生了，皇帝需要閹黨來對抗文官集團，而閹黨也需要皇帝當靠山，皇帝如果失去了權威，那麼閹黨肯定遭殃，比如明武宗朱厚照剛剛繼位不久，吏部尚書焦芳等文官集團，就快開始脅迫朱厚照懲治八虎，雖然八虎咎由自取，但這種脅迫的形式說明文官集團並不把皇帝當回事。
這正如嘉靖帝朱厚熜繼位，文官集團起初甚至不許讓朱厚熜的親生父親進太廟，在名分上要以明孝宗為皇考，親生父親興獻王改稱“皇叔考興獻大王”，祭祀之時對自己的親生父母要自稱“侄皇帝”，不但如此，文管集團宣佈，反對者都是奸邪，當斬，這就是明朝著名的“大禮儀事件”，就算一個平常人，這都是極大的侮辱，何況皇帝。
文官集團把持朝政威脅到了皇權，皇帝就需要反擊，其中的一項手段就是扶持閹黨，在天啟年間，閹黨最具影響力的就是魏忠賢，只有他能對抗東林黨，崇禎殺了魏忠賢，在一定程度上等於對自己權力的削弱。
其實魏忠賢是要殺的，只是崇禎選擇的時間不對，當時大明已經搖搖欲墜了，需要的是內部的穩定，而魏忠賢的死恰恰打破了文官集團與閹黨的平衡，失去壓制的東林黨人，站在了地主階級的一方，對下層人民影響十分巨大，甚至連賑災的錢糧都敢於攔阻，魏忠賢那麼權勢滔天，他都沒不敢做，而且閹黨對於下層民眾的影響其實並不是很深。
總之，崇禎因為判斷上的失誤，殺了該殺卻不能殺的魏忠賢，大明出現權利失衡，以他自己的能力又無法駕馭群臣，致使大明無力應付內憂外患的局面，想必後來對於誅殺魏忠賢，崇禎一定是後悔的。
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