2003年11月3日，沧州市公安局刑警支队对新华公安分局刑警大队送检的血样进行化验，先确定杨新海血型为"B"型，正与皖、豫、鲁、冀系列杀人、抢劫、弓虽.女干案犯罪分子是同一血型，这无疑又使侦破向前跨进一大步。
这个消息立即报告到沧州市公安局局长张峰那里。张峰向市局刑警支队支队长董金生指示：为了作出更准确的判断，连夜派人将血样送到省公安厅做ＤＮＡ检验。随后，张峰亲自来到新华公安分局刑警大队审讯室，叮嘱审讯人员：要对嫌疑人严加看管，保证做到万无一失。新华公安分局的刑警随即把杨新海铐在一张很坚固的审讯椅子上，用4副手铐分别铐住他的手脚。而此时的杨新海仍然侥幸地认为：沧州的公安机关没有掌握住他作案的任何证据，不久就会放他走人。他以前不是曾经蹲过铁笼子吗？蹲不了半天就放出来了。
当天，沧州市公安局刑警支队和新华公安分局刑警大队连夜把杨新海的血样送到300公里外的石家庄，对杨新海进行DNA检验。河北省公安厅很快通过DNA技术鉴定：杨新海的DNA和多起杀人大案犯罪嫌疑人所留在现场的毛发等遗物的DNA图谱相同度为999999％。11月5日，河北省公安厅确定：这个自称叫杨新海的人就是皖、豫、鲁、冀系列杀人、抢劫、弓虽.女干案的犯罪嫌疑人。
公安部督办的1号系列杀人案嫌疑人杨新海在沧州落网的消息很快传开了。当刑警们前去沧州市供销宾馆对杨新海住过的205房间进行依法搜查时，正在值班的女服务员已经听说杨新海被抓前就住在这家宾馆，她说："太可怕了！虽然那天不是我给他登记的，但一想起他杀了那么多人我就害怕，我一连两个晚上没睡好。"
杨新海住过的房间被公安部门查封，房间钥匙也被带走。
公安机关与杨新海的激烈交锋还在后面。
皖、豫、鲁、冀系列杀人、抢劫、弓虽.女干案件在沧州取得实质性的进展后，河北省公安厅十分重视，立即成立审讯工作指挥部。2003年11月5日上午，河北省公安厅刑侦局局长魏晋虎、副局长陈国平带领有关人员，从石家庄赶到沧州。为迅速攻克此案，指挥部专门研究制定了对杨新海进行讯问的工作方案，并从各地抽调有讯问特长的13名警官组成3个讯问小组。
11月5日15时，杨新海被从新华公安分局刑警大队审讯室带了出来，公安人员为他戴上专用头套，押上了一辆封闭式的警车，杨新海猜不出这是将他带到哪里去，但他仍在想：这是要放我，还是转移羁押地点？
15时30分，在沧州市公安局刑警支队大院里，18名着装整齐的民警列成两排，6名武警战士笔直站立，透出一种庄严与威慑。这时，3辆警车鱼贯而入，身高只有160米的杨新海，被两名武警战士押了出来。当罩在他头上的专用头套被摘掉时，他被突然出现在眼前的威严气势所惊怵，他的双腿一下子软了下去，几乎是被武警战士架着进入讯问室的。
杨新海是一个对自己的外在形象十分看重的人，他一遍遍地整理衣服，衣扣一定要端正，衣角一定要平整。尽管平时他大都睡在公园里、车站前，但衣服稍微一脏，就去住旅店，这样做的目的只有一个：洗洗衣服。杨新海被锁进审讯椅之后，很认真地系好衣扣、拽平皱褶、掸去灰尘。
审讯室里很静。杨新海抬起头时，几双威严的目光正盯着他，他感到气氛紧张，心里发毛。
"杨新海！"一个雄浑的声音在喊他，这个多次进宫的惯犯习惯性地答应了一声："有。"
"你知道为什么把你带到这里来吗？"
"不知道。"
审讯人员斩钉截铁地说："你犯下了侵害人民生命财产的滔天大罪！"
杨新海的大脑"轰"地一下子就炸开了，他心里暗暗地叫道：完了，我的末日到了！但他不知道这些公安人员到底能掌握他的多少犯罪证据，他还在作着软弱无力地顽抗："我不知道你说的是什么意思。"
"你知道发生在皖、豫、鲁、冀4省的系列杀人案吗？"
"不知道。"
这时，审讯人员适时出示了河北省公安厅的DNA鉴定书，说："经对犯罪嫌疑人遗落在现场的毛发进行DNA鉴定，与你血液中的DNA鉴定相比对，两者的DNA相同度为999999％。"
此时，杨新海才明白了，原来11月3日抽他的血是为了做DNA鉴定的。他知道，科学技术已认定他是犯罪嫌疑人，有证据在，抵赖完全是徒劳，他也知道自己的罪恶有多大，警察这次是不会放过他的了。他后悔当初作案时没有把所有的毛发都剃光，不然他们就没有做DNA鉴定的条件了。但他还不肯束手就范："我知道ＤＮＡ是科学，他的准确率不就是99％吗，我就是那1％！"
审讯人员拍案而起："杨新海！你在安徽、河南、山东、河北作下了多起灭门惨案，现在证据确凿，你还不肯交代罪行吗？"
杨新海不敢正视那威严的目光，他小眼珠转了转说："我是作过几起案，但我知道，也不能每个现场都留有毛发。有证据的，我就认，没有证据，你们也别吓唬我。你们总不能把全国的案子都往我头上推。"
"你先说说，哪些起案件是你作的？"
经过3个多小时的较量后，杨新海无法用自己的诡辩去回答民警的讯问。他的眼睛朝天花板盯了好大一会儿，里面噙满了泪水，说："看样子你们是认准我了，要不然也不会摆这么大阵势。尽管你们没打我，没骂我，可我知道今天是躲不过去了。"
2003年11月5日18时，杨新海开始交代罪行。
正式讯问工作从11月5日18时开始，沧州市公安局刑警支队副支队长赵福增，进行了首轮讯问。经初审发现，杨新海因屡受公安机关打击，反侦查意识较强，抗拒心理非常突出。河北省公安厅刑侦局魏晋虎局长、陈国平副局长、沧州市公安局张峰局长、宋津生副局长、董金生支队长通过监控现场指挥，根据审讯情况及时调整审讯策略，适时拿出相关证据，形成强大的震慑。经过几个回合的较量，杨新海节节败退，11月5日夜22时30分许，他只得拿着地图一桩一桩地指认自己的犯罪现场。这次审讯中他初步交代，他在皖、豫、鲁、冀4省杀人作案多起，在公安部通报的皖、豫、鲁、冀18起系列杀人、抢劫、弓虽.女干案件中，除亳州"1·9"案件外，其余17起案件均系其一人所为。此外还交代出，在河南的西华、扶沟、叶县、临颍等地杀人作案5起的犯罪事实。
当杨新海开始供述自己曾经犯下的罪恶时，脸上始终堆着笑容，像一个敝帚自珍的守财奴，向众人展示自己的"宝贝"。他把杀人当成追求刺激的载体，把用抢来的钱去嫖娼当成寻求幸福的手段。民警在讯问的过程中，要求他把所有抢劫、盗窃的犯罪事实叙述出来时，他透出一脸的不屑说："那些鸡毛蒜皮的事还说它干啥？"
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