辣椒落花落果的原因分為兩種，一種是因為生理原因造成，另一種則是因為病蟲害的危害導致。所以防止辣椒落花落果，應該先了解辣椒落花落果的真正原因以後才可以進行防治。
1、物理原因。
溫度原因：辣椒喜歡在空氣乾燥但土壤溼潤的環境下生長，如果空氣溫度超過35度後，辣椒的授粉受精就會收到影響，植株徒長造成辣椒受精不良出現子宮萎縮，從而出現落花落果現象。在長期陰雨的天氣下，光照不足，也會影響到辣椒的花粉管伸長，出現落花現象。
溼度原因：在辣椒長期處於乾旱的環境下，水分不足會抑制辣椒對營養的吸收，從而出現花果因營養不足造成落花落果現象。但是辣椒長期處在水分過多的土壤中時，根系的呼吸將會受到影響，出現爛根現象，也會出現落花落果現象。
養分原因：辣椒對氮肥吸收較少，如施氮肥過多會造成辣椒植株徒長，辣椒的營養生長和生殖生長失去平衡，花和果實因營養不足便會出現落花落果現象。
栽培管理不當：種植辣椒時種植密度，辣椒植株在長大以後便會造成植株間通風不暢、光照不足、光合作用能力下降，便會出現落花落果現象。
解決方法：在種植辣椒的要選擇抗病能力高的品種，合理密植，保證田間的通風透光條件，使辣椒在一個好的環境下成長。合理灌水和施肥，辣椒喜歡溼潤的土壤，所以在天氣乾旱時，要及時澆水，保證土壤一直處於溼潤環境下。在辣椒的花蕾期可適當的增施磷鉀肥，減少氮肥施入，可促進辣椒分枝開花結果。在辣椒的結果期施入適量的複合肥，有利於辣椒的膨大。
2、病蟲害危害。辣椒常見的病蟲害有炭蛆病、葉枯病、棉鈴蟲、煙青蟲等，這些都是辣椒落花落果的主要因素。
防治方法：病毒性病害會造成辣椒植株萎縮，辣椒不能正常分枝生長，嚴重影響了辣椒的產量，所以要做到早發現早治療，在病毒性病害發生的初期，可以通過噴藥的方法來防止病毒蔓延，並噴施葉面肥來提高辣椒植株的抗病能力。對於棉鈴蟲和煙青蟲這種啃食辣椒果實導致辣椒落果的，可在發現有害蟲後及時將落果清理出辣椒田，並及時噴藥將害蟲殺死。
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