對於金秋砂糖桔幼樹的管理，根系生長是重點，其長勢的好壞直接影響幼苗的抽梢情況，人為的進行保梢保葉，成長幼樹的光合作用才能增大，光合作用所產生的光合產物越多，輸送到幼樹內部的養分就越多，根系就會越發達，這樣就會形成一個良性循環，促進幼樹的生長。
沙糖桔果樹生長髮育、開花結果與溫度、日照、水分(溼度)、土壤以及風、海拔、地形和坡向等環境條件緊密相關，這些條件影響最大的數溫度。即使差異0.5℃的氣溫有時會出現截然不同的結果。沙糖桔生長髮育要求12.5~37℃的溫度。
秋季花芽分化要求晝夜溫度分別為20℃左右和10℃左右，根系生長的土溫與地上部大致相同。過低的溫度會使沙糖桔受凍，甜橙-4℃，溫州蜜柑-5℃時會使枝葉受凍，甜橙-5℃以下，溫州蜜柑-6℃以下會凍傷大枝和枝幹，甜橙-6.5℃以下，溫州蜜柑-9℃以下會使植株凍死。
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