对于金秋砂糖桔幼树的管理，根系生长是重点，其长势的好坏直接影响幼苗的抽梢情况，人为的进行保梢保叶，成长幼树的光合作用才能增大，光合作用所产生的光合产物越多，输送到幼树内部的养分就越多，根系就会越发达，这样就会形成一个良性循环，促进幼树的生长。
沙糖桔果树生长发育、开花结果与温度、日照、水分(湿度)、土壤以及风、海拔、地形和坡向等环境条件紧密相关，这些条件影响最大的数温度。即使差异0.5℃的气温有时会出现截然不同的结果。沙糖桔生长发育要求12.5~37℃的温度。
秋季花芽分化要求昼夜温度分别为20℃左右和10℃左右，根系生长的土温与地上部大致相同。过低的温度会使沙糖桔受冻，甜橙-4℃，温州蜜柑-5℃时会使枝叶受冻，甜橙-5℃以下，温州蜜柑-6℃以下会冻伤大枝和枝干，甜橙-6.5℃以下，温州蜜柑-9℃以下会使植株冻死。
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