一般化疗引起的骨髓抑制，最先造成白细胞减少，随之是血小板减少，有部分也会出现贫血。只要造血干细胞未受到严重影响，此间血象及骨髓的变化是暂时的，可以恢复。胃肠道反应，主要表现食欲不振、恶心、呕吐、腹泻、甚至便血。如阿糖胞苷是最容易引起恶心、呕吐的抗白血病药。
白血病患者因为化疗药物引起心脏不良反应主要为心肌损害，临床多见心律失常、心功能不全等。心脏毒性是化疗药物常见不良反应之一，也是影响化疗效果的原因之一。引起心脏不良药物主要有蒽环类抗生素及三尖杉酯碱类药物。阿霉素、表阿霉素、4—去甲氧柔红霉素均有心脏不良反应。其他药物，如大剂量阿糖胞苷、大剂量氨甲喋昤等亦可见心脏不良反应。
急性白血病等患者因气血亏损，心气不足，心阳不振，极易出现心悸、气短等症状。加之化疗药物可损害心脏，使心气、心血更加虚损。心气、心血虚损较轻者，仅见心悸、心慌等症状;严重者可出现心阳暴脱，阴阳离决等危候。
化疗对机体的免疫功能有着不同程度的抑制作用，这也是化疗后患者易于感染或感染不易控制的原因之一。多数抗白血病药物有不同程度的肝脏损伤，引起肝内门脉纤维化，甚至肝硬化。其他包括肾脏、肺、心肌损害和神经毒性。脱发也是比较常见的副作用。
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