有其父必有其女,如何讓後代更優秀(含抗病性預測遺傳計算示例)

賓夕法尼亞州立大學奶牛遺傳學副教授今年四月,CDCB(奶牛育種委員會)首次公佈了對6種疾病包括乳房炎、酮病、真胃移位、子宮炎、胎衣不下和產後癱瘓的抗性基因評估。

此前,我們在《養牛》首刊中有討論過關於這些評估的數據來源以及它們與其他疾病的關係評估的更多細節。

本文將對這些特性的PTA(預測傳遞力)分佈進行評估,考慮到父系對女兒證明有貢獻的記錄數量,以及由此產生的可靠性,在之後的續篇中,我們將繼續討論這六種疾病的評估與其他特性的關係以及父系對其的影響。

有其父必有其女,如何讓後代更優秀(含抗病性預測遺傳計算示例)

乳房炎抗病性的預測遺傳力

基於公牛PTA的乳房炎抗性分佈如圖1所示,包含在這個圖中的PTAs數據是來自於2015年及之後人工配種出生的近5000頭公牛。之所以選擇這個出生年,是因為這可以為目前可用的公牛提供一個預期PTA範圍的指示。


有其父必有其女,如何讓後代更優秀(含抗病性預測遺傳計算示例)

正如圖中所示,大多數公牛的PTA都在+0.5%至+2%的區間,但最高的接近+4%,最低的接近-2%。這些數據是相對於2010年出生公牛基數為0而言,且這些數據大多數是高於0,這表明bull studs選擇的公牛和市場上的公牛的乳房炎抗性優於平均值。

公牛抗病性的高與低

體現到女兒身上是怎樣的?

通過比較第90百分位和第10百分位的公牛,可以幫助我們瞭解抗病性高公牛和抗病性低公牛的女兒在可預測發病率上到底有多大的差異。

關於自2015年出生的公牛這6個性狀的抗病性百分位數據如表1,關於經女兒證明過的公牛將在以後討論。

有其父必有其女,如何讓後代更優秀(含抗病性預測遺傳計算示例)

表1基因檢測青年公牛第90和10百分位的PTA(預測傳遞力)

Rel GYS:基因檢測青年公牛的平均可信度

Rel DP:經女兒證明的公牛的平均可信度

讓我們來看看高(第90百分位)和低(第10百分位)公牛的乳房炎抗性情況,高抗性公牛的PTA為+2.2%,低抗性公牛的PTA為-0.1%,這意味著高抗性比低抗性公牛的女兒患乳房炎的幾率低2.3%。

以一群泌乳階段患乳房炎率10%為例,這意味著這群奶牛的乳房炎抗病性為90%,那麼高抗性公牛的女兒的乳房炎抗病性為92.2%(90+2.2),而低抗性公牛的女兒的乳房炎抗病性為89.9%(90-0.1)。因此,我們預測高抗性公牛的女兒患乳房炎率為7.8%,而低抗性公牛的女兒患乳房炎率為10.1%。

從表格中,我們可以看到高抗性和抵抗性公牛的女兒在乳房炎上的特性差異最大,其次是子宮炎和酮病。

因為乳房炎是最普遍的奶牛疾病,這在很大程度上就是為什麼乳房炎存在最極端偏差的原因。但另一個極端是,較少看到真胃移位和產後癱瘓特性的極端偏差。

表中也包含了基因檢測青年公牛的平均可信度,其範圍從乳房炎抗病性的59%到產後癱瘓抗病性的41%,這也表明了為什麼奶牛乳房炎發病率要比產後癱瘓高。

有其父必有其女,如何讓後代更優秀(含抗病性預測遺傳計算示例)

在圖2中,我們總結了這6種疾病特性的PTAs,可以讓大家對女兒發病率的差異有個大致的瞭解,CBCD或bull studs不會以這種形式展示這些信息。

相反,

CBCD將衡量PTAs的經濟價值,以便在未來將其納入淨價值。這是合理的,因為有些疾病的成本要比其他疾病更高,例如,真胃移位比胎衣不下的治療費用更昂貴。

研究這6種特性,發現與2010年出生的奶牛相比,一般公牛的女兒預期抗病性增加3.5%~4.5%,第90百分位公牛的女兒抗病性增加+5.2%,第10百分位公牛的女兒抗病性增加+1.9%。

缺少數據

事實上,可用於公牛的女兒健康遺傳評估的數據遠遠少於產量及其他性狀評估的數據。表中的數據包括了公牛2009年及以後出生女兒的數據,而且這些公牛都處於基因組時代,至少擁有100位女兒的記錄數據。

平均而言,這些公牛的女兒中,平均患有胎衣不下(43)和乳房炎(40)的數量最多,患酮病(29)和產後癱瘓(20)數量最少,女兒數量最多的那頭公牛有2845頭患有胎衣不下,1330頭患有產後癱瘓。

為了做一個比較,這些公牛的女兒們有泌乳記錄的平均頭數為744,最多的是80840頭。可以在表中看到,

經女兒證明過的公牛的可信度更高,但是與我們對大多數其他特性的預期相比,仍然相對較低。

雖然這可能是CBCD的第一次抗病性評估,但事實上,這項工作已經開展了一段時間。我們已經在進行抗病性的選擇了,健康特性,如長壽性、女兒懷孕率、體細胞和乳房特徵,有助於幫助牧場選擇更健康的奶牛。

這是培育高產、高效、健康奶牛的又一次積極努力,可以預期,隨著CBCD健康數據庫的增加,這些評估的可信度會穩步提高。

原文|Chad Dechow

編譯 | 王封霞

排版 | 楊小寒


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