雪鹰365
首先得指出基因突变不管是DNA复制时内部产生的自发突变，还是外部环境中的物理化学及生物因素产生的突变都有可能发生在基因表达的调控区而影响基因表达水平，如突变发生在基因编码区5‘端的转录启动子或增强子区可改变转录水平，突变发生在mRNA5'非编码区可改变翻译水平。逆转录病毒基因随机插入人基因组不仅会引起变异，而且可导致插入片段邻近区突变数增多。引起一些无法预计的基因表达变化。
秦浚川
我们首先要明确一个概念，遗传信息只会从DNA传递到蛋白质，而不会逆向传递。换句话说个体不会因为外在变化而影响遗传的稳定性。一个截肢者，他的后代不会没有腿。我想这一点你是明白的。
再说你举的那几个例子，隐隐指向“用进废退论”。这个理论其实早已经被达尔文和孟德尔驳斥过，不过到今天为止“用进废退论”依然有他的蛊惑性——人尾巴怎么没了？按遗传进化论和自然选择学说，没有证据证明无尾巴更易于生存，动耳肌也是如此。对于这个现象，你得区分个体器官的“用强废弱”和基因“用进废退论”的本质区别。
那动耳肌来说，由于人类社会的发展，我们再不需要时刻竖起耳朵倾听周围动静，警惕外来的突然袭击或者捕食猎物。用的少，动耳肌肌肉神经得不到刺激也就功能弱化。那还有没有这个基因呢？有的，也在表达，只是我们不用，功能退化了。类似的证据很多。我们拿模型来简单理解，如果一个小孩很小就是高位截瘫，他的下肢肌肉骨骼因为得不到足够刺激，长大后会极度萎缩。但是下肢基因是正常表达的，他的孩子自然有腿。如果他的孩子甚至子子孙孙也和他一样从小高位截瘫，他们家代代都是下肢萎缩，这个现象能不能证明下肢萎缩是遗传呢？显然不能。动耳肌退化的模式和这个类似。
人类器官的用强废弱并不会造成基因改变。能够改变基因的无非是外界因素导致的突变或者异变，以及自然环境对优势基因的筛选。不过随着遗传学研究的不断深入，科学家发现有很多基因会因为环境差异而出表达差异。比如一段编辑热休克蛋白的基因，环境高温时它会表达，低温则失去表达活性。最近几年炒作的很火的基因检测，其实就是对疾病易感基因的检测，疾病易感人群的基因编码出现小误差，导致在日常生活饮食或者生存环境中某种疾病更容易被诱发，这算是你所说的基因开关的意思。
另：尾巴这事说不清，因为灵长类有尾和无尾的分化远在人类文明产生之前，有可能和自然选择有关——由于某个特殊原因，有尾猿人生存环境更加恶劣导致有尾基因群体被淘汰。生物界历史太悠久，这么长时间，什么都有可能发生。植物最早从藻类进化到蕨类从而首次成功登上陆地花了将近二十亿年。
纯手打，希望能解你惑！
西窗闲读
石中青
我认为基因变异是由于地球上新生生物的出现（例如超级细菌，致病菌），他打开了人基因变异的开关，人和动物如果自然淘汰基因不会突变，如果药理治疗基因不会突变，如果化学治疗基因容易突变。
朱朱53832
变异的后果对一个物种可以是有助，中性和有害的，遗传是对变异后代天然筛选的结果。
人生旅途999
遗传基因的变异只有受到外界环境和内在因素，例如：辐射和癌变才会引起遗传基因突变而改变基因的表达〝开关〞。
