工程審計中結算和決算的區別主要從兩者的含義、兩者的範圍、兩者的主體、兩者的時間、兩者的作用、兩者依據法規、審計側重點這七點方面分析，具體工程審計中結算和決算的區別分析如下：
第一、工程結算和工程決算含義不同
●工程結算含義：工程結算是指施工企業按照合同規定的內容全部完成所承包的工程，經驗收質量合格，並符合合同要求之後，通過編制工程結算書向建設單位進行工程價款結算，是施工單位向建設單位索取工程報酬的依據。
●工程決算含義：工程決算應稱作基本建設項目竣工財務決算，通過編制竣工決算書計算整個項目從立項到竣工驗收、交付使用全過程中實際支付的全部建設費用, 反映了工程建設項目的最終造價，是正確核定新增固定資產價值、辦理固定資產交付使用手續的依據。
第二、工程結算和工程決算的範圍不同
●工程結算確定的是工程建設階段的工程價款，包括建築工程費、安裝工程費等;
●竣工決算包括從籌集到竣工投產全過程的全部實際費用，即包括建築工程費、安裝工程費、設備工器具購置費用及預備費以及監理費、設計費、建設單位管理費等費用。
第三、工程結算和工程決算的主體不同
●工程結算是在建設單位和施工單位之間進行，有兩個平等的主體;
●工程決算是由建設單位對工程項目發生的費用進行歸集、分配、彙總編制，只有一個主體。
第四、工程結算和工程決算的時間不同
工程結算髮生在工程決算之前，只有工程結算完成後，才能進行工程決算。
第五、工程結算和工程決算的作用不同
●工程結算是施工單位向建設單位索取工程報酬的依據，反映的是項目建設階段的工作成果;
●工程決算是正確核算新增固定資產價值，考核分析投資效果，反映的是綜合、全面、完整的項目建設的最終成果。
第六、工程結算和工程決算的依據法規不同
目前，工程結算的編制主要依據財政部、建設部聯合發佈的《建設工程價款結算暫行辦法》;
工程決算的編制主要依據財政部發布的《基本建設財務管理規定》。
第七、工程結算和工程決算的審計側重點不同
工程結算審計主要側重於工程造價審計;
工程決算審計包含了對工程及財務等全部建設費用的審計。
工程結算與工程決算有區別也有聯繫
兩者都是是工程建設領域常用的兩個重要概念，也是政府投資建設項目審計的兩項主要內容。工程竣工結算與決算是建設工程估算、概算、預算、結算、決算“五算”中的最後兩個環節，工程結算與決算最終反映建設項目實際工程造價和建設情況的綜合體現，工程結、決算涉及諸多主體、環節與內容，能夠對實際建設情況的質量、真實、完整、全面地反映、評價等經行反映。
工程結算與工程決算主要聯繫體現在工程結算和工程決算都是政府投資建設項目審計的重點內容;工程結算與工程決算項目建設單位都是工程結算和工程決算共同的主體;工程結算是工程決算的組成部分，工程結算是決算的基礎工程結算與工程決算主要體現聯繫體現在工程結算和工程決算都是政府投資建設項目審計的重點內容;工程結算與工程決算項目建設單位都是工程結算和工程決算共同的主體;工程結算是工程決算的組成部分，工程結算是決算的基礎，工程結算應按照決算的要求，在相關內容上與決算保持一致。
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