現在我們的DNA測序技術已經飛速發展，我們也分析出了越來越多的物種的基因組。

在這之中，對於全基因組分析，特異圖 是一種新穎而重要的工具。特異圖可以用直觀和有效的方式來映射和可視化全基因組信息，例如基因密度，DNA甲基化分佈，基因組一致性等。

但是，大多數用來基因組測定的軟件程序僅適用於少數幾種模型，例如人，鼠標和蒼蠅，或具有有限的應用場景。越來越多的非模型物種需要測序，因此也需要比較完備的工具來測定更多生物的基因組信息。於是開發人員也做出了很多努力來開發基因測序軟件，其中RIdeogram便是很厲害的基因組測序工具，據科學技術報告，RIdeogram不光可以測序，還能一鍵可視化基因信息，自動畫出SVG圖像，節省了使用者繪圖的時間。

可能很多人不知道SVG是啥，這裡簡單介紹下。SVG是可伸縮矢量圖形，它是在編程中一種用於描述二維圖形的語言。SVG圖形在可擴展標記語言（XML）文本文件中定義，所以人們可以輕鬆地使用任何文本編輯器，如記事本，或繪圖軟件來創建和編輯SVG圖形，因此SVG的編輯並不難。

另外，RIdeogram工具也可用於顯示兩個或三個基因組之間的同義比較。此外，RIdeogram可以可視化雙重基因組比較，例如人與小鼠之間的基因組同構性。與常染色體相比，人和小鼠X染色體之間的同義塊幾乎佔據了每個X染色體的全部，這暗示了在真核哺乳動物譜系中X染色體的高度保守的同義關係。於是，使用RIdeogram工具可以很容易發現這種關係。

那麼RLdeogrm是用什麼編程語言寫成的呢？

RIdeogram是用R語言編寫的。R語言是廣泛用於統計計算，數據分析和圖形的最流行的編程語言之一。不過，R圖形包不是基於任何現有的圖形系統構建的，因此使用起來不太方便。

開發者使用R環境讀取自定義輸入文件，並在座標系中計算圖形元素的位置。接著R語言將所有元素信息按照XML格式寫入文本文件，該文件用於通過SVG語言定義圖形。RIdeogram的基因繪圖功能也比較完善，可以滿足大部分圖形版本的需求，例如JPG，PNG，PDF等等各種版本的圖形都可以繪出來，滿足了不同使用習慣的人的需求。

使用RIdeogram可以瞭解基因如何在整個基因組中分佈。例如，計算出蛋白質編碼基因的數量，可以將其視為連續數據和500個隨機選擇的非編碼RNA的位置，包括核糖體RNA（rRNA），轉移RNA（tRNA）和microRNA（miRNA）），都可以將其視為離散數據。

隨後RIdeogram會將基因密度信息作為重疊特徵映射到圖像上，並在圖像旁邊添加跟蹤標籤，並分別代表rRNA，tRNA和miRNA。可以說這是一種非常方便的工具了。

總的來講，隨著生物學和計算機科學的發展，醫學界對生物基因組的測序需求越來越大，而測序的難度卻非常大，因此特別需要計算機提供越來越高級的工具幫助基因測序。於是乎很多技術便應運而生，其中RIdeogram便是時代的產物，它可以進行基因測序並自動繪製圖像，節省了更多的時間成本。可以說，科學改變世界，帶來了更美好的前景。