上海市疾控中心病原檢測團隊嚴格篩查樣本。本文圖片均由 上海市疾控中心 供圖
2020年1月20日晚，國家衛生健康委確認上海市首例新型冠狀病毒感染的肺炎確診病例。
從無到有，上海是如何經過層層把關最終確認的呢？
2月1日，上海市疾控中心對外發布上海市首例新型冠狀病毒實驗室診斷誕生全記錄，這其中離不開上海市疾控中心病原檢測團隊的努力。
早在2019年12月底，武漢出現不明原因肺炎的消息開始在社會上散播時，上海市疾控中心病毒檢測實驗室主任接到病原生物檢定所所長指令後，帶領團隊開始著手一系列事情：梳理應急試劑儲備量、擬製可能需要開展的工作計劃，部署具體環節，做好隨時迎接應急指令下達的準備。
2020年1月7日，中國疾病預防控制中心發佈武漢首例新型冠狀病毒感染病例。
此時，距離新春假期只有2周的時間，如果是往常，大多數人早已擬定了返鄉和出遊計劃，或歸心似箭、或心向遠方了。而病例的公佈，彷彿吹響了全國的戰鬥號角，一切都隨之而緊繃起來。
上海市疾控中心病細緻分析實驗數據。
實驗室團隊密切跟蹤事態發展，調動“人”和“物”進入作戰狀態：對人，重申應急值守制度，節假日期間留守加班的思想動員，調整值班人員組合，加強力量配備；對物，啟動應急試劑採購。
硬件齊備了，更重要的是“軟件”也得跟上：團隊邊做邊摸索，對幾次送來的應急篩查樣本，細緻分析實驗數據，謹慎研判實驗結果，反覆確認高通量快速實驗室檢測方案，並將其納入上海市整體防控方案……一次次的檢測都排除了新型冠狀病毒感染事件。
2020年1月16日，實驗室燈火通明。通過反覆驗證結果，確認新型冠狀病毒核酸檢測呈現弱陽性——這很可能成為上海首例疑似病例——事關重大，團隊毫無遲疑，立即向中心領導上報了結果。
是或不是？面對此次來勢洶洶的新型病原體，實驗室也是充滿了忐忑，慎之又慎——全國還未公佈穩定可靠的核酸鑑定方法，如何才能確證？
上海市疾控中心病原檢測團隊將樣本送到國家疾控中心。
根據國家疾病預防控制中心下發的2019年疑似新型冠狀病毒肺炎防控方案，樣本需要通過全基因測序，序列比對高度同源才能作為疑似病例上報國家疾控中心，首例疑似病例更是需要國家疾控中心複核才能公佈。
得益於“三年行動計劃”建立的二代測序平臺，團隊立即開展從標本中直接測序。
經過整整兩天兩夜的核酸提取、測序、生信分析，並將樣本上送到國家疾控中心，終於完成了首例複核所需要的所有工作，並得到了國家疾控的回覆：上海市疾病預防控制中心送檢的1例疑似2019新型冠狀病毒肺炎患者呼吸道標本3 份,經對送檢標本進行核酸複核檢測，結果均為 2019 新型冠狀病毒陽性。
至此，首例新型冠狀病毒實驗室診斷最終完成。
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