公元前406年，這一年是伯羅奔尼撒戰爭倒數的第三個年頭，對於雅典人來說，戰爭的形式可謂日益嚴峻。彼時，雅典人經歷了遠征西西里島的慘敗以及雅典城的內亂，在庫濟庫斯的勝利本在一定程度上為雅典人挽回了頹勢，然而最近在諾提昂的海戰失敗傷亡雖不大，在戰略上卻使得雅典人失去了在庫濟庫斯帶來的優勢。戰後，亞西比德倒臺，同時連累了色拉西布洛斯和塞拉門尼斯，使得雅典在這般緊急之時失去了優秀的將軍。
除了缺失了優秀將領，雅典人的財政也出現了極大問題，在戰前雅典人的國庫大約擁有6000塔蘭同銀幣和500塔蘭同未鑄幣的金銀，每年則有1000塔蘭同白銀的收入，比之斯巴達領導的伯羅奔尼撒聯盟，可算是遠為富裕。但是雅典帝國龐大的艦隊，由於海軍的昂貴，維繫海軍所需的軍費是巨大的，根據現代史學家的估算，戰爭前期雅典人每年為海軍約支付1600塔蘭同，陸軍則為400塔蘭同，即便不計其餘意外的開支，每年軍費數額也達到了2000塔蘭同之多。
戰爭更是嚴重影響了海上貿易，雅典聯盟下的各盟邦日子過得都不如前，而隨著戰爭時間的持續，雅典對盟邦要求的貢金開始增加，這也導致了多個盟邦的反水，到了前406年6月雅典人為了重組艦隊，已然將衛城的勝利女神金像融化融化來支付軍費。便是在這樣的情形下，雅典人在阿吉紐西取得了史無前例的大勝，隨後卻又由於雅典民主的愚蠢，生生毀滅了這場勝利帶來的一切。
全盛時的雅典帝國
對斯巴達人來說，要想真正擊敗雅典，就必須摧毀雅典人的海上力量，這也是雅典人敢於和斯巴達人叫板的底氣，前文提及伯羅奔尼撒聯盟遠不如雅典帝國富有，而縱然是雅典帝國要維繫一支龐大艦隊去打一場曠日持久的戰爭在財政上也不免捉襟見肘，為了能獲得資金，斯巴達人便尋求到了波斯帝國支持。起初，總督提薩弗涅斯的政策是想要看見雅典斯巴達兩大聯盟兩敗俱傷，以獲漁利。是以提薩弗涅斯在對斯巴達人資金支持上總是拖拖拉拉，不肯盡數交付，至於他所承諾的波斯腓尼基艦隊的支持，更只是一句空話了。長久以來，雅典人在海上的優勢並未改變，斯巴達人對這位總督的態度也自然談不上好了。
到了前408年，情況出現了變化，由於提薩弗涅斯和斯巴達人的決裂和想令雅典斯巴達兩敗俱傷的政策失敗，他被國王大 流士二世所罷免，取代他的是國王的次子小居魯士。這是一個年輕氣盛且野心勃勃的年輕人，這年的他還不到17歲，由於他的母親，也就是波斯王后對他偏愛和對自己長子的不喜，使得小居魯士有了取代兄長成為繼承人的野心。就這樣，急於表現自己的小居魯士和斯巴達的呂山德這個同樣野心勃勃的人相遇了。
呂山德是一個莫薩克斯人，就是說他的父親為斯巴達人，母親是一個黑勞士奴隸或者父親是一個因為貧困而喪失斯巴達公民權的人，他的父親雖然貧困，但卻擁有貴族血統，也許就是這樣的出身，使得他更熱衷於權勢。前407年，呂山德當選了斯巴達的海軍司令，他和小居魯士接觸後，一開始兩人就便相處的十分融洽，小居魯士希望在自己支持斯巴達勝利後，可以在日後自己爭奪繼承權時有一個有足夠權威影響斯巴達的人支持自己，他看中了呂山德，而急於擊敗雅典人獲得榮譽的呂山德也看中了小居魯士。
小居魯士
小居魯士十分的慷慨，他不但付清了提薩弗涅斯拖欠的軍費，還答應了呂山德提出的給每位斯巴達槳手漲三分之一工資的要求，甚至預付了一個月的軍餉。有了足夠軍費的呂山德證明了自己絕非泛泛之輩，他通過更高的工資吸引雅典經驗豐富的水手反水（財政到了極限的雅典人做不到為水手付出同等的薪水），在諾提昂便成功的擊敗了雅典海軍。只是，到了前406年由於斯巴達海軍司令一職不能連任，司令被換成了卡利克拉提達斯。
這位新任司令雖非無能，甚至在個人品格上算得上優秀，但他的理念和呂山德十分不同，他缺少呂山德的雄心，他擔心斯巴達若是建立類似於雅典的海外帝國，那樣帶來的經濟利益和奢靡的生活方式會腐化斯巴達人。而對於斯巴達人竟然要對"蠻族"也就是波斯人阿諛奉承獲取資金感到憤慨，宣稱如果他能安全回國，他會盡最大努力達成和雅典人和解。和這麼一位與波斯人不善的海軍司令作戰，對雅典人來說卻是一個機會。
卡利克拉提達斯放棄了地理優勢，將斯巴達的海軍基地從以弗所遷到了對波斯人不友善的米利都，得益於波斯人之前的資金支持，此時他手中有170艘戰船且擁有素質一流的水手，雅典的將軍科農手中只有70艘，雅典的將軍科農做了最大努力去備戰，但還是不免戰敗，科農勉強將40艘戰船撤出戰場，又費了很大力氣終於派了出一艘船前去雅典請求支援。
三列槳帆戰船
得到了消息的雅典人融化了勝利女神尼刻的金像，他們在一個月內恢復到了110艘三列槳帆戰船，但優秀水手的缺失卻難以彌補，雅典人甚至讓奴隸上了船，這也就出現了整個伯羅奔尼撒戰爭中的第一次，雅典人在海軍的質量上不及敵人，7月份，在八位將軍的率領下雅典艦隊前往薩摩斯島，期間又從盟邦手中得到了45艘戰船，卡利克拉提達斯擔心遭到兩面的夾擊分出50艘戰艦監視科農，自率120艘戰船迎擊雅典人，阿吉紐西戰役便這樣打響了。
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