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首先明确，个人独资企业虽然称为“企业”，但是自从2001年1月1日起，个人独资企业不再缴纳企业所得税，至对投资者个人取得的生产经营所得征收个人所得税。
个人独资企业缴纳个人所得税分为两类，一类是为个人独资企业的员工缴纳个人所得税，另一类是企业的经营所得缴纳个人所得税。
（一）缴纳个人所得税的种类
1.个人独资企业的员工缴纳个人所得税，按照《个人所得税法》第十一条规定，工资薪金所得并入员工个人年度综合所得计征个人所得税，由企业以代扣代缴方式，按月或者按次进行“预扣预缴”税款；需要办理汇算清缴的，应当在取得所得的次年三月一日至六月三十日内办理汇算清缴。
2．个人独资企业的经营所得。《个人所得税法》第十二条，纳税人取得经营所得，按年计算个人所得税，由纳税人在月度或者季度终了后十五日内向税务机关报送纳税申报表，并预缴税款；在取得所得的次年三月三十一日前办理汇算清缴。
（二）个人独资企业的纳税人
依照《中华人民共和国个人独资企业法》规定，个人独资企业以投资者为纳税义务人。
（三）个人独资企业适用税率
1.个人独资企业实行查账征收办法的，其税率比照“个体工商户的生产、经营所得”应税项目，适用5%-35%的武技超额累进税率；
2.实行核定征收，按照应税所得率计算其应纳税所得额，再按照其应纳所得税额的大小，适用5%~35%的五级超额累进税率。
（四）个人独资企业应纳税所得额计算
个人独资企业应纳税所得额=收入总额-成本-费用-各项损失
其中收入总额=商品销售收入+营运收入+劳务服务收入+工程价款收入+财产出租或者转让收入+利息收入+其他收入+营业外收入。凡是企业从事与生产经营以及生产经营有关的活动所取得的各项收入都包括。
（五）不得扣除项目
个人独资企业个人所得税缴纳比照个体工商户，其中4项在计算应纳税所得额时不得扣除
1. 投资者的工资，按照每人3500/月费用标准扣除；
2. 投资者及其家庭发生的生活费不得扣。
3. 企业生产经营和投资者及其家庭生活共用的固定资产，难以划分的，按照比例扣除
4. 计提的各种准备金不得扣除
（六）核定征收方式计税
第一步：计算应纳所得税额
应纳所得税额=应纳税所得额*适用税率
第二步：计算应纳税所得额=收入总额*应税所得率=成本费用支出额/(1-应税所得率) *应税所得率
其中应税所得率一般根据行业特点和主管税务机关核定确定。
（七）企业年度亏损
个人独资企业年度亏损， 允许用本企业下一年度的生产经营所得弥补，下一年度多的不足弥补的可以递延弥补，最长不得超过五年。
（八）报送表格
投资者在预缴个人所得税时，报送《生产、经营所得个人所得税申报表（A表）》
年度终了后30日内，报送经营所得时，报送《生产、经营所得个人所得税申报表（B表）》
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1、个人独资企业。不缴纳企业所得税，而是缴纳个人所得税。参见《企业所得税法》第一条第二款规定：个人独资企业、合伙企业不适用本法。而适用《个人所税法》，按《个人所得税法》第二条第二款“个体工商户生产、经营所得”项目征收个人所得税。
2、税务机关对个人独资企业个人所得税的征收方法有二种，一种是查账征收适用于会计核算比较齐全的，另一种是核定征收。具体采用哪种征收方法由主管税务机关确定。
3、采用查账征收方法的，以每一纳税年度的收入总额，减除成本、费用以及损失后的余额，为应纳税所得额，然后根据个人所得税确定的税率表中对应的税率计算应纳税款。
4、采用核定征收方法的。依据国家税务总局关于印发《企业所得税核定征收办法》（试行）的通知》规定，采用按企业销售收入乘上应税所得率来计算应纳税所得额，然后，根据个人所得税确定的税率表中对应的税率计算应纳税款。
扩展资料：
个人所得税根据不同的征税项目，分别规定了三种不同的税率：
1、工资、薪金所得，适用7级超额累进税率，按月应纳税所得额计算征税。该税率按个人月工资、薪金应税所得额划分级距，最高一级为45%，最低一级为3%，共7级。
2、个体工商户的生产、经营所得和对企事业单位适用5级超额累进税率。适用按年计算、分月预缴税款的个体工商户的生产、经营所得和对企事业单位的承包经营、承租经营的全年应纳税所得额划分级距，最低一级为5%，最高一级为35%，共5级。
3、比例税率。对个人的稿酬所得，劳务报酬所得，特许权使用费所得，利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得，偶然所得和其他所得，按次计算征收个人所得税，适用20%的比例税率。其中，对稿酬所得适用20%的比例税率，并按应纳税额减征30%；对劳务报酬所得一次性收入畸高的，除按20%征税外，应纳税所得额超过2万元至5万元的部分，依照税法规定计算应纳税额后再按照应纳税额加征五成；超过5万元的部分，加征十成。”
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个人独资企业所得税只交个人所得税不交企业所得税！采取5级超额累进制税率！按年计算，分月预缴！新版所得税自2018年10月实施，
相比于老版本，依然税率5%到35%五个级数，但全年应纳税所得额提高不少，减税效果突出！
个人独资企业往往还面对着增值税，消费税、教育附加税，城建税等，税负较重！
加倍保
个人独资企业查账征收和核定征收各有各的好处。
查账征收，要求账务要完整规范。好处是，有收入就缴税，没收入就不缴。在企业没收入、收入比较少，或者利润不高时，可以不缴税或少缴税。但坏处是，必须要有完整合法的各种原始票据。
核定征收则相反，对账务的要求不高，甚至建不建账都可以，但即使没有收入或利润，也需要按核定的金额缴税。如果企业收入和利润很高，又没有足够的原始票据可以使用，可以选择核定征收。
