材料學：是合併前原山東工業大學實力最強的學科，材料科學與工程專業還是國家一級重點學科。1995年起學院實行按院招生，一、二年級本科生的課程基本統一，三年級按專業方向分流，進行定向培養。1998年設立院教務室，統管全院教學工作，並以係為單位開展日常教學的組織與管理工作。學院的人才培養原則是：寬口徑、厚基礎、高素質、複合型。學院正在構築材料科學與工程學科本科教學的寬口徑平臺，加強材料與計算機技術、信息技術和生物技術學科的交叉與結合，確立複合型人才的培養模式，使學院培養的各個層次的專業技術人才具備更強的適應能力，以滿足國民經濟建設和社會發展的需求。
生物學：早在1901年山東大學堂(山東大學前身)創辦時，就開設過這方面的課程。在一批優秀的老一輩科學家們的帶領下，山東大學生物學科享譽海內外。生命科學學院現有生物科學、生物技術、生態學和生物工程四個本科專業，並設有本科實驗教學中心。另建有微生物技術國家重點實驗室、發育機制與基因調控山東省高校重點實驗室，生態學與生物多樣性學校重點實驗室。微生物學為國家重點學科，發酵工程學、發育生物學為山東省重點學科。
數學：數學學院是山東大學歷史最悠久的學院之一。其前身是成立於1930年的“國立青島大學理學院數學系”。當時，山東大學只有“文理兩院”，共七個系，數學系主任由理學院院長、著名數學家黃際遇兼任，這標誌著山東大學數學學科的誕生。經過幾代人的辛勤耕耘，山東大學數學學科不斷髮展壯大，已成為專業門類齊全、人才培養體系完善、居於國內先進行列並在國際上有一定影響的重要學科，並在2007年被認定為“一級學科國家重點學科”。現有數學與應用數學、信息與計算科學、統計學、信息安全四個本科專業，涵蓋了數學學科的所有方向。1991年被國家教委批准為首批“國家理科基礎科學研究和教學人才培養基地”。
此外，山東大學還有其他一些非常具有優勢和特色的學科，如產業經濟學、科學社會主義與國際共產主義運動、文藝學、中國古代史、粒子物理與原子核物理、凝聚態物理、物理化學、微生物學、機械製造及其自動化、控制理論與控制工程、人體解剖與組織胚胎學、內科學(心血管病)、婦產科學、流行病與衛生統計學等專業也是國家級特色專業;朝鮮語、信息安全、通信工程、軟件工程(設2個專業方向)、集成電路設計與集成系統、臨床醫學、歷史學、生物技術、電氣工程及自動化、藥學、光信息科學與技術、英語、機械設計製造及其自動化、材料成型及控制工程、工商管理等專業屬於國家級特色專業。
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