富田興合苑業主的大事小事33、高通量測序;間期,有絲分裂,紡錘

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富田興合苑業主的大事小事33、高通量測序;間期,有絲分裂,紡錘


2019-05-11 08:20,網友“表觀遺傳學”發了篇名為“詳解 UV 誘導的 DNA 損傷和修復”的論文。

(“這是篇博士級別的論文…我們假裝不知道這一點,然後把它消化掉…”中學生說。)

…Uv:ultraviolet的縮寫…

…ultraviolet(英文):n.紫外線…見《富田興合苑業主的大事小事28》…

“在分子生物學研究中…我們經常使用 DNA 損傷模型…其中非常常見的一種手段是 UV。UV 照射後,DNA 損傷形式是怎樣的?DNA 損傷後,細胞又是怎麼修復的呢?如何檢測全基因組的 DNA 損傷和修復事件呢?DNA 損傷修復異常與疾病又有怎樣的聯繫?…”網友說,“本文整理了復旦大學胡晉川研究員2017 年發表的題為The Cartography of UV-induced DNA Damage Formation and DNA Repair(紫外線誘導DNA損傷形成與修復的製圖)的論文… 綜述文章的核心要點,以期對上述問題進行解答。”

胡晉川(復旦大學青年研究員):博士,青年研究員,復旦大學附屬上海市第五人民醫院兼職教授。

畢業院校:北京大學,中國科學院微生物研究所

工作經歷

青年研究員 復旦大學,生物醫學研究院/上海市第五人民醫院,(2018.1-今)

研究助理 美國北卡羅萊納大學教堂山分校,(2017.6-2017.12)

博士後 美國北卡羅萊納大學教堂山分校,(2012.6-2017.5)


教育經歷

博士 中國科學院微生物研究所,(2004-2012)

學士 北京大學,生命科學學院,(2000-2004)


研究方向

課題組利用生化方法和高通量測序技術研究染色質環境中的DNA損傷與修復…

…生化方法:生物化學方法…

…高:象形文字。甲骨文字形,象樓臺重疊之形。漢字部首之一。從“高”的字多與高大或建築有關。本義:離地面遠,從下向上距離大…

…高2:在一般標準或平均程度之上的:~速度。體溫~。見解比別人~…

…通:形聲字。從辵(chuò),甬(yǒng)聲。本義:沒有堵塞,可以通過…

(…形聲:一種造字法…是說字由“形”和“聲”兩部分合成,形旁和全字的意義有關,聲旁和全字的讀音有關。如由形旁“氵(水)”和聲旁“工、可”分別合成“江、河”…

…形聲字:用形聲造字法造出來的字…)

…量:形聲。本義:用量器計算容積或長度…

…量2:數量:降雨~。產~…

…通量:在流體運動中,單位時間內流經某單位面積的某屬性量,是表示某屬性量輸送強度的物理量。在大氣科學中,包含動量通量、熱通量、物質通量和水通量(百度百科);流體、粒子或能(如輻射能)通過已知面的速率(百度漢語)…

[…動量(Momentum):又稱線性動量(Linear Momentum)。在經典力學中,動量表示為物體的質量和速度的乘積。是與物體的質量和速度相關的物理量,指的是運動物體的作用效果…見《富田興合苑業主的大事小事15》…]

…高通量篩選(High throughput screening,HTS)技術是指以分子水平和細胞水平的實驗方法為基礎,以微板形式作為實驗工具載體,以自動化操作系統執行試驗過程,以靈敏快速的檢測儀器採集實驗結果數據,以計算機分析處理實驗數據,在同一時間檢測數以千萬的樣品,並以得到的相應數據庫支持運轉的技術體系,它具有微量、快速、靈敏和準確等特點。簡言之就是可以通過一次實驗獲得大量的信息,並從中找到有價值的信息…


富田興合苑業主的大事小事33、高通量測序;間期,有絲分裂,紡錘


高通量測序技術 中的“高通量” 是什麼意思?——網友提問

“高通量是相對於第一代測序的。第一代測序只能一次測1個樣品的1段序列,產生的數據量相對來說很小,而高通量測序一次能夠產生的數據量在幾十G上百G,可以一次測很多的樣本…”網友“河傳楊穎(yǐng)”說。

“在2000年的時候,3700、MegaBace等儀器上的測序也是高通量測序…是相對手工測序來說的…”河傳楊穎接著說,“不過到2005年以後,高通量測序就改指第二代測序…比3730(一代測序儀器)等第一代測序的通量提高了成千上萬倍,甚至上億倍,所以稱為高通量測序…”

高通量測序技術(High-throughput sequencing):又稱“下一代”測序技術(“Next-generation” sequencing technology),以能一次並行對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定和一般讀長較短等為標誌。

富田興合苑業主的大事小事33、高通量測序;間期,有絲分裂,紡錘


染色質:指間期細胞核內由DNA、組蛋白、非組蛋白及少量RNA 組成的線性複合結構,是間期細胞遺傳物質存在的形式。

…間期:細胞從一次有絲分裂結束到下一次有絲分裂的分裂期之前的時期,是有絲分裂的準備階段。在間期進行染色體的複製,包括其DNA、RNA和蛋白質的合成。

間期是細胞循環中細胞生長和工作的時段,一個細胞在細胞循環90%左右的時間是在間期中。

間期應注意與前期、中期、後期、末期相區分,後四者屬分裂期…

…有絲分裂(mitosis):又稱間接分裂,指一種真核細胞分裂產生體細胞的過程,特點是細胞在分裂的過程中有紡(fǎng)錘(chuí)體和染色體出現,使已經複製好的子染色體被平均分配到子細胞,這種分裂方式普遍見於高等動植物(動物和高等植物)…

…紡:形聲字。從糸(mì),方聲。本義:將絲麻纖維製成紗或線…

…紡錘:紡紗、紡線工具,是一箇中間粗兩頭尖的小圓棒,木製或鐵製,把棉絮或棉紗的一端固定在上面,紡錘旋轉,就把棉絮紡成紗,或把紗紡成線…

富田興合苑業主的大事小事33、高通量測序;間期,有絲分裂,紡錘


“核小體:由DNA和組蛋白形成的染色質基本結構單位。每個核小體由146bp的DNA纏繞組蛋白八聚體1.75圈形成…

請看下集《富田興合苑業主的大事小事34、組蛋白,核小體,DNA長度單位——bp

》”

若不知曉歷史,便看不清未來


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