周印濤
首先我糾正一下您的用語！豬舍環境中並不存在您所說的有益菌，“有益菌”的概念一般是指在動物腸胃生長的、對動物健康起到正面作用的細菌。可以放心的對豬舍進行消毒，但是像你所說的消毒水很多不知道是多到哪種程度？
一、頻繁消毒的危害
1、造成溼度過大：會導致豬隻關節炎多發，或者產房仔豬黃痢、白痢增加；
2、豬群頻繁應激：每一次消毒都是對豬隻一次應激，有可能會造成免疫力的下降；
3、刺激豬隻呼吸道：有刺激性的消毒劑頻繁消毒，更是早晨豬隻呼吸道的刺激，會誘發呼吸系統疾病。
二、豬舍環境中的危險因素
1、生物膜：通俗地說，生物膜是由細菌在其分泌的粘液（粘多糖）內形成的結構。包裹著細菌的生物膜為細菌提供了保護，使得後者很難被清除。
處理辦法：使用洗潔精或泡沫清洗劑進行浸泡祛除。
2、連續飼養造成病原菌殘留：沒有乾燥過程的一種飼養方式，產床、限位欄及圈舍需要空圈乾燥的過程，乾燥才是病原菌最致命的方式。
處理辦法：批次小單元飼養，圈舍空圈乾燥1周以上。
3、消毒藥輪替使用：每種消毒藥都有不同的殺死病原菌的殺菌譜，輪替使用可以極好的解決這個事情。
最後，消毒的頻率並不是越多越好，而是要把握度，不至於消毒密度的增加換來的只是心理的安慰，重要的是在殺滅病原體的前提下，保證豬群的生物安全的保障。希望有幫助！
豬貝笑談
去年非洲豬瘟，我們這邊基本沒怎麼管理的大多數都存活了，到是弄得乾乾淨淨還有打疫苗的，大部分死了！我家和我爺爺家的豬圈離了幾十米，我家的又打擾，又消毒，還打疫苗，幾十個全部沒了，我爺爺也一起料理死了的豬，和我老爸一起抬去埋起來！他家的沒管這些，卻過得好好的！
所以呀，我覺得吧，像豬圈這些地方偶爾殺殺毒就行了，別太過度了！不然適得其反！
純糧酒迪松
我對此問題有以下兩個觀點；
觀點一：你說的益菌應該是生活在身上或體內的對吧，如果按照嚴格的消毒方法它對體內的益菌不會有太大的影響。當然多多少少會殺死一些表面的，只要規範消毒管理對豬是沒有影響的。注意吃的東西不要用藥水消毒，吃消毒藥會傷害豬的腸胃。傳染病多發期必須整個豬舍內外都要消毒，整個養殖場，包括豬舍外面的圍牆外。其實人進進出出的傷害是最大的，不管是誰，領導檢查也好，客戶參觀也好，必須做好消毒防護工作，特別是鞋底過一下消毒。
觀點二：營造一個舒適的環境，豬是一個比較容易浮躁的動物，冬天的保暖工作，夏天的降溫工作，都是必不可少的。因為養殖工作量也不小，而且每天要做同樣的事情，可以安裝一些新的設備，全自動，半自動都可以，比如自動下料機，就跟漏斗一樣又不用管不用電，把料放裡面豬哄一下就下去了。還有自動放水壓力機，哪怕遙控的半自動的都行，不用費時費力在每天重複做的事情上。其實有些事情腦洞大開一下可以讓你一舉兩得，既衛生又省時。
希望我的觀點對你有幫助，謝謝！
阿郎觀點
豬舍消毒是好事，但是豬舍過多消毒不盡然都是好事。其實豬舍消毒越多越不好，豬病就越多，為什麼呢?豬舍消毒在殺死有害菌的同時也殺死了有益菌，自然界裡有害菌有益菌是共存的，消毒越多甚至可能造成有些豬病的成因。
自然界裡的有害菌與有益菌是共存的而且是相互制衡的，我們在消毒殺菌實際是破壞了自然界的生態平衡，同時也殺滅了對豬有益的有益菌。生態 平衡也一個生態鏈，自然界的生態鏈受到破壞就會有新的病種產生。
縱觀歷史來看，豬是一個雜食動物而且是一個愛食汙物的動物，動物都有自己的遺傳基因特性，這個特性是不能更改的。比如豬愛在土裡拱，吃土、在泥裡打滾，還特喜歡在髒一點的水裡泡，還有一個特殊的特性就是前邊的豬拉屎、尿 後邊的豬就馬上 去拱吃喝，難道豬不知道髒嗎不知道吃了會得病嗎?
農人小張AA
豬舍常規消毒後，會殺滅豬舍內的有益菌群與有害菌群，使豬舍在短時間內成為一個空白環境。空白環境往往持續1—2天，隨後消毒劑揮發失效，空白環境中由於沒有有益菌的壓制，有害菌會迅速繁殖。
面對這種狀況，我們以往只有兩種方案，要麼覺得萬事大吉,其實有害菌在迅速繁殖，依舊禍害豬隻的健康，誘發疫情；另一種方案就是不斷加大消毒頻率，不給有害菌滋生的機會，但是那樣會對豬隻造成嚴重應激與刺激，進而影響豬隻健康生長。這就是我們當前的消毒狀態！ “愈消愈毒、愈毒愈消”堪稱消毒惡性循環，結果豬病從未杜絕！
那麼面對如此境況，我們到底該怎麼辦？其實環境安全，只差一步！那就是豬舍消毒後,務必種“種子”！——“種子”就是益生菌種！
常規消毒24小時之後，需要快速重建舍內益生菌微生態環境，應在豬舍噴撒有益菌菌種，在此建議噴撒護舍安，在有害菌還未滋生之前，就使有益菌長起來。益生菌可以通過營養競爭機制及分泌抑菌物質來壓制有害菌的生長，促使豬舍在較長一段時間內保持益生菌佔主導的狀態，從而促進豬隻健康生長。可見接種了益生菌菌種，不僅可以有效壓制有害菌，使豬舍環境真正健康安全，同時也可以有效降低常規消毒劑的使用頻率，減少豬舍潮溼度並解決頻繁消毒對豬隻造成的刺激性影響。
勤奮的老趙
提問者有可能搞錯了一個事實——我們所說的有益菌是指腸道內的有益菌，腸道內的微生物。外界一般不存在有益菌，外界的細菌一般是致病性的，或者是不具有致病條件的。我們豬舍裡面噴灑消毒液，主要是消毒豬圈裡面的細菌。不會對胃腸道內的細菌產生影響。
豬場內的細菌種類
豬場內還是大多以革蘭氏陽性菌為主，我們豬場是5000多頭的規模母豬場，在非洲豬瘟發生之前，有一個科研組進來採集場內細菌。發現了有30株細菌，其中有28株是陽性菌，兩株是陰性菌。
採集的圈舍有：妊娠舍、配種舍、隔離舍
細菌種類：主要包括鏈球菌、芽孢桿菌、葡萄球菌、李氏桿菌、沙門氏菌、大腸桿菌等。
大家也看到了豬場內這些細菌的種類，差不多就有十幾種，這些基本上在一定條件內，如果場內通風不暢、豬的免疫力沒有達到標準，那100%會造成小豬腹瀉，嚴重的話會造成死亡。
致病機理
有很多人都認為我們人之所以會發病，主要是因為體內或者是腸道內的某些微生物不平衡所導致的。其實這種觀點我是比較贊同的。而且自古以來我們國內的中醫都講究，陰陽平衡，調節身體，首先就是調節的陰陽二氣，只有胃腸道內的某些細菌處於一種平衡狀態時，致病菌才不會有治病的能力或者是條件，如果這個平衡被打破，那肯定會生病。
反芻動物抗生素使用時需要注意
你既然說到了這個細菌平衡。其實在反芻動物的用藥過程當中有著嚴格的要求，一般情況下有很多反芻動物有些抗生素是不能使用的。最忌諱的一點是不能讓反芻動物口服抗生素。
主要是因為我們破壞了他瘤胃當中的微生物平衡，剩下的一些乳酸菌起到了非常大的作用，產生了大量的乳酸，因此你口服很多藥物，反而嚴重時會造成酸中毒。
聚焦三農瞭解事實
可減少一點藥，基本上藥再多都沒有用的，豬的成功和失敗關鍵就是每年的氣候變化原因。就好像今年疫情變化一樣的，全國都能發生的。按照畜牧局規定用藥劑量，謝謝幫到你參考。
國外北漂生活
會的，任何消毒製劑都會對有益菌及有害菌及病毒有滅殺和抑制作用的，只不過是各個菌群和病毒對各種成分消毒劑的耐受性不同而以，還有消毒劑的濃度對消殺作用也有很大影響。
所以，養殖人員對豬舍的消毒作業，一定要嚴格按照操作規範來操作，而對消毒製劑類型的選擇，以及使用方法，使用濃度則需要有專業人員的指導來使用了，不能盲目使用，以免不但起不到消殺作用，反而造成資源的浪費，甚至對豬群的健康產生負面影響，這是每個養殖場（戶）要注意的。不知我的回答能幫到大家嗎？希望大家多交流指導。
取與舍之鄉野村夫
消毒水一般作用都是作為一種物理殺滅細菌的方式。而有益菌是細菌中的某些對人體有益的細菌。有益菌也稱之為益生菌，主要是各種雙歧桿菌、乳酸桿菌等，是人體健康不可缺少的要素，可以合成各種維生素，參與食物的消化，促進腸道蠕動，抑制致病菌群的生長，分解有害、有毒物質等。總之，有益菌會被消毒水殺滅。
山上的野蘭花
肯定的:
一般來說豬舍消毒是指通過物理或化學的方法對豬舍病原微生物進行殺滅，以切斷傳播途徑，阻止和控制傳染病的發生。而常規豬舍消毒用的最多的是化學性消毒劑。
畜舍環境是一個微生態平衡系統，畜舍中存在一定比例的有害菌和有益菌，在給豬舍用化學性消毒劑消毒過程中，我們往往忽略了一個現象：化學性消毒不僅將畜舍內的病原微生物殺死、同樣也將畜舍內的有益菌殺死了。細菌的繁殖速度很快，往往12小時後又重新恢復至原樣，細菌捲土重來，有益菌無法與之處於相互抑制狀態，若豬隻抵抗力下降，則很容易受到細菌、病毒等的侵襲，進而感染髮病
