駱嚴團隊iScience發文揭示蘇木化METTL8通過m3C誘導R環和腫瘤發生

2020年3月06日,浙江大學基礎醫學院駱嚴教授課題組在Cell子刊《iScience》雜誌在線發表了研究論文:“ The SUMOylated METTL8 induces R-loop and Tumorigenesis via m3C”。文章報道了蘇木化METTL8主要通過影響核仁內或接近核仁的遺傳組織來促進腫瘤發生,並通過其酶催化3-甲基胞苷 (m3C)調控R-loop形成。

METTLs

一般認為,表觀遺傳與組蛋白共價修飾有關。甲基轉移酶蛋白家族(METTLs)共享一個保守的腺苷蛋氨酸(SAM)結合位點。在哺乳動物中,已經證實幾種METTL蛋白的功能,例如人體細胞中METTL3和METTL14複合物在mRNA中形成m6A。METTL8作為甲基轉移酶蛋白家族一員,是最早發現的一種張力誘導蛋白(TIP),參與間充質細胞中脂肪組織的轉型,調節小鼠胚胎幹細胞發生差異化等。儘管已經發現METTL8在RNAs中修飾m3C,但是其作用機制仍不明確。

駱嚴團隊iScience發文揭示蘇木化METTL8通過m3C誘導R環和腫瘤發生

R-loop

R-loop通常發生在具有多樣性細胞功能的全基因組結構上,是細胞內一種特殊的三股DNA-DNA: RNA混合結構,包括一條DNA: RNA雜合鏈(由RNA與其同源DNA序列互補雜交形成)和一條單鏈DNA。目前已有大量文獻報道,過量的R-loop會導致基因組不穩定、DNA複製損傷。由於其DNA: RNA雜交性質,R-loop的形成通常發生在基因組的GC啟動子區域。

除此之外,也存在於促進poly(A)依賴性轉錄終止的G-rich序列和DNA轉錄超螺旋化區域。此外, R-loop DB中能預測R-loop的全基因組分佈,這表明了轉錄和R-loop之間可能的聯繫。目前為止,METTL3能通過m6A調控R-loop,但是關於m3C的生物學功能尚不清楚。

新的R-loop通路

於是,課題組通過純化METTL8複合物,發現METTL8和R-loops核仁共定位,METTL8依賴它的m3C活性,存在與細胞核內,特別是在核仁內調節R-loops。

有趣的是,通過SUMO-SIM的相互作用,SUMOylation能穩定複合物,使METTL8定位到核仁。在異種移植小鼠模型中,發現m3C活性和SUMOylation是METTL8致瘤性的必要因素。該研究建立了一個新的R-loop通路,SUMOylated核酸甲基轉移酶(METTL8)通過存在於m3C上的酶活性調控R-loop。

該課題得到了新加坡醫學生物研究所Brian Burke博士,新加坡國立大學附屬醫院結直腸外科Ridzuan Farouk,以及浙江大學醫學院蛋白質平臺馬騁的幫助。主要工作由生化系博士後高翔博士,博士生張利紅完成,博士生張學雲及博士生張利紅為共同第一作者,高翔博士為共同通訊作者。

本研究受到了國家科技部973(重大基礎研究)項目,國家自然科學基金委面上項目,浙江省科技廳重大專項等項目的資助。

駱嚴課題組鏈接:

https://person.zju.edu.cn/luoyan2012

原文鏈接:

https://www.cell.com/iscience/fulltext/S2589-0042(20)30152-8#%20

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