截止至 4 月 9 号，全球新冠感染人数已经突破 150 万，造成了接近 9 万人死亡。但由于检测能力的不足，各国医学界广泛认为目前确诊人数被极大程度的低估。
提高检测能力和灵敏度，对遏制新冠的全球传播至关重要。
来自麻省理工的「CRISPR 之父」张锋从疫情爆发以来就一直关注新冠疫情，并早早地将自己的「夏洛克」技术用于新冠诊断。
4 月 8 号，他再次带领团队在预印本平台 BioRxiv 发表了题为《LAMP-Seq: Population-Scale COVID- 19 Diagnostics Using a Compressed Barcode Space》的论文，提出了使用环介导等温扩增测序（Loop-mediated isothermal amplification-seq, LAMP-Seq）结合 DNA 条形码标记以实现新冠病毒大规模诊断的可能。
目前商用核酸检测技术需要先纯化 RNA 后逆转录，然后才进行荧光定量 PCR，这整个过程往往需要耗费数个小时，而且成本较高。一人份试剂盒的价格在 100 - 200 元人民币。而且由于检测需要专业的实验室，传统 PCR 检测的速度被极大程度的限制了。
但本次研究中，张锋团队提出的 LAMP-seq 思路可以极大程度的缩短检测时间。
该技术在获得鼻/咽拭子、痰或者粪便样品后无须进行提取纯化，可以直接将样品放入反应体系进行逆转录环介导等温扩增（RT-LAMP），并在过程中通过引物打上 DNA 条形码。扩增产物随后会进行灭菌处理，整个过程只需要 40 分钟。扩增灭菌后的样品将被集中运送至检测中心并混合成样品池，含有超过 10 万个病人样品的样品池会进一步 PCR 扩增。通过下一代测序技术的深度测序，就能准确识别出样本池中每一位病人是否感染病毒。
随后，研究团队通过建模分析了该方法的准确率。发现只要全球流行率低于 1.3%，在使用 10000 个不同条形码序列和每个样品 5 个条形码的情况下，同时跑 10 个样品池得到的假阴性和假阳性率都低于 0.2%。由于一台标准的 Illumina NextSeq 测序仪单次测序可在在 14 小时内产生 2 亿个测序读数，研究人员预测一台机器 14 小时就能诊断 10 万病人样品，诊断速度非常快。
研究人员还计算出该方法每人的检测成本只需要 7 美金，如果找到能够替代的 Bst 3.0 聚合酶的其他聚合酶，或者提高 Bst 3.0 聚合酶的产量，可进一步将检测成本降低 4 倍。
虽然 LAMP，DNA 条形码和高通量测序技术并不新鲜，但张锋团队将他们天马行空的组合起来，为疫情潜在的更大规模爆发提供了一种新的大规模诊断思路。
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