现实中，我们每个人都有主观意识，那么，人为什么会有意识呢？意识是从哪里来的？动物有意识么？对这些问题的探讨，需要从生命的进化，尤其是大脑的进化谈起。
意识与大脑
在雷电的作用下，甲烷等无机物可以通过化学反应形成有机小分子，比如氨基酸。它们随雨水落入原始海洋之中，并逐渐聚合形成有机大分子。某些有机大分子具有特定的功能，比如其一端可以在光照下分解水产生氢气和氧气，从而能够在气体的反推作用下定向移动，表现出所谓的“趋光性”或“避光性”。
有机大分子还可以组合成多分子体系，稳定的多分子体系最终被一层膜包围，形成原始细胞，这是最初的生命形式。单个细胞聚集成多细胞，形成特定的组织。并且，在适应环境中，细胞间产生了分工，有些细胞负责感应光线压力，有些细胞负责运动，有些则负责吞噬和分解有机物，还有一些，是负责协调各部分功能的，这就是脑结构的雏形。
脑起源
最简单的脑结构便是脊椎索，它的核心是几个神经细胞，比如膝跳反射便是在脊椎索的指挥下完成的。多条脊椎索勾连而成的复杂结构，便是最初的大脑。但此时的大脑类似于计算机，它并没有意识，而是固定地执行各种预设的命令。但大脑与计算机不同，大脑的命令不能被精准复制，在自然选择下，一些预设命令被继承，一些则被遗弃，原始脑缓慢地积累着经验。
随着预设的命令增多，命令间不可避免地出现重复和冲突，重复表现为惯性，冲突表现为选择性。一个生命，无论什么原因，在对峙世界的时候犹豫了，没有立即作出反馈，这便是意识的诞生。它们与石头等无生命的物体表现截然不同。比如，我们对着石头踢一脚，石头就沿着踢的方向去了，然后停止，再踢一脚，依然如此；而一个小动物则不然，世界给它一个刺激，它会有各种不同的表现，这次向左动，下次向右动，这代表它面对世界有多种不同的应对模式，其中有一个选择的过程。
选择导致意识的诞生
最开始的时候，应对模式的选择并不是清晰的，它没有主宰，是不自觉的。而且，选择的无效性也并不能被很好的记录下来，所以动物很容易上当。上当的次数多了，相应的应对模式便逐渐失效，直至类似的模式全部失效，这时，便剩下远离或躲避模式，这是恐惧心理的来源。
在不断逃避伤害的基础上，不自觉的潜意识产生了一个判断的主宰，它进一步延缓了我们应激反应的时间，却也通过比较给出了更加精准的应对模式。这个主宰的一部分运行模式被准确记录，并在适当的触发下可以重复运行，就好像我们能够主动感知一样，这便是真正的意识，它是自觉的。
意识与潜意识
其实，这个主宰就是人们通常说的我，我是大量不自觉的潜意识的主宰，具有永恒，唯一，自在的特性。我一经产生，便不仅仅要主宰自身，还要主宰一切。自觉意识的逻辑叫形式逻辑，它是抽象的，清晰的；不自觉意识本身也有逻辑，它是具象的，拓扑的。通常，前提的正确性需要具象的逻辑，而抽象的逻辑可以保证结论与前提的正确性等同。
