公元1432-1595年被定义为晚期真腊时期，此时国家正面临内忧外患、日渐衰落的局面。
公元1431年，柬埔寨首都吴哥被暹罗军队占领，首都由吴哥迁至金边，意味着吴哥王朝的终结。迁都造成的劳民伤财也使得国力日渐衰退，同时国家也一度陷入与暹罗交战的漩涡中。
真腊国王蓬黑拉·亚特于公元1432年即位，在位十五年后，由其子诺雷接任。
诺雷执政仅五年离世，其弟拉马蒂菩提于公元1472年继位，在位仅一年，其执政期间一方面发生了宫廷内乱；另一方面遭遇了战争的爆发。
拉马蒂菩提在与暹罗军队作战时被俘，死于暹罗监狱。那段时期被俘的国王并不只拉马蒂菩提，达摩罗奢也是暹罗控制下的傀儡国王，还曾将柬埔寨的呵叻以及尖竹汶割让给泰国。
晚期真腊也曾出现过短期中兴。安赞于公元1516-1556年在位，公元1510年安赞的军队击败暹罗军队，使得军民大受鼓舞，并将战胜的地区命名为暹粒，寓意战争的胜利。
此后，巴隆·拉嘉一世继位，再次成功击败暹罗军队，并收复呵叻。
1571年，暹罗王子纳黎萱战胜缅甸，随后在1594年，暹罗十万大军攻打柬埔寨首都洛韦，统治者萨塔一世出逃，九万柬埔寨居民被俘，吴哥时期的文献资料也被毁于一旦，晚期真腊结束。
早期真腊、吴哥王朝、晚期真腊被统称为真腊王国。十六世纪末期进入柬埔寨王国时期，这一时期柬埔寨被法国占领，成为柬埔寨近代史的开端。前后历经九个多世纪的真腊王国从此退出历史舞台。
参考附录：
附录一 吴哥王朝时期君主世系：
1 阇耶跋摩二世 公元802–850年
2 阇耶跋摩三世 公元857–877年
3 因陀罗跋摩一世 公元877–889年
4 耶输跋摩一世 公元889–900年
5 曷利沙跋摩一世 公元900–923年
6 伊奢那跋摩二世 公元923–928年
7 阇耶跋摩四世 公元928–941年
8 曷利沙跋摩二世 公元942–944年
9 罗真陀罗跋摩二世 公元944–968年
10 阇耶跋摩五世 公元968–1001年
11 优陀耶迭多跋摩一世 公元1001–1002年
12 苏利耶跋摩一世 公元1002–1050年
13 乌迭蒂耶跋摩二世 公元1050–1066年
14 曷利沙跋摩三世 公元1066–1080年
15 阇耶跋摩六世 公元1080–1107年
16 陀罗尼因陀罗跋摩一世 公元1107–1113年
17 苏利耶跋摩二世 公元1113–1150年
18 陀罗尼因陀罗跋摩二世 公元1150–1160年
19 耶输跋摩二世 公元1160–1166年
20 特里布婆那迭多跋摩 公元1166–1177年
空位－ 占婆统治吴哥5年
21 阇耶跋摩七世 公元1181–1219年 实际在位
22 因陀罗跋摩二世 公元1226–1243年
23 阇耶跋摩八世 公元1243–1295年
24 因陀罗跋摩三世 公元1295–1307年
25 因陀罗阇耶跋摩 公元1307–1327年
26 阇耶跋摩九世 公元1327–1336年
27 达柴·帕恩 公元1336–1340年
28 摩诃·涅槃婆陀 公元1340–1346年
29 兰蓬罗阇 公元1346–1351年
空位－ 暹罗入侵 公元1352–1357年
30 苏利耶迭 公元1357–1363年
31 婆罗摩罗摩 公元1363–1373年
32 达摩输 公元1373–1393年
33 奔哈·亚 1393年–1463年
34 蓬黑阿·亚特 公元1432–1467年
35 诺雷 公元1467–1472年
36 拉马蒂菩提 公元1472–1473年
37 达摩罗奢 公元1468–1504年
38 安赞 公元1516–1556年
39 巴隆·拉嘉一世 公元1556–1567年
40 萨塔一世 公元1567–1594年
附录二 真腊历史演进：
约中国秦汉时代，真腊为东南亚扶南属国，公元6世纪中叶，北方吉蔑部落兴起。
公元7世纪中期，扶南国王去世，扶南太子流亡爪哇，建立山帝王朝。
公元7世纪末期，真腊国王刹利·质多斯那消灭扶南国余部，伊图那先继位为真腊国王。
公元705–707年，真腊国分裂为陆真腊和水真腊，水真腊定都婆罗提拔，陆真腊定都在今老挝境内。
公元8世纪末期，水陆真腊成为夏连特拉王朝属国。
公元9世纪初期，水陆真腊统一。
公元802年，吴哥王朝建立，地处今缅甸边境和马来半岛北部地区。
公元12–13世纪，吴哥王朝与暹罗、占婆交战。
公元1431年，暹罗攻占吴哥，吴哥王朝灭亡。
公元1432年，晚期真腊开始，迁都金边。
公元1528年，安赞迁都至洛韦。
公元1531年，安赞袭击暹罗的巴真武里，安赞被誉为柬埔寨中兴之主。
公元1557年、1559年、1562年巴隆·拉嘉三次与暹罗作战并取得胜利，收复呵叻。
公元1594年，晚期真腊结束。