转基因食品安全一直是个备受关注的问题，但其实转基因相关的上游还有一些问题也在引起热议——那就是关于转基因农作物种子的问题。这个问题有以下四个小问号。
1转基因作物种子怎么来的？
这个问题可分两层意思来回答：一是种子怎么来的，二是转基因种子怎么来的。目前的粮食作物种子大多是杂交种子，这种种子是通过两种稳定遗传的自交系（父本和母本）杂交后而获得的。这种种子都是种业公司每年在特定地点来杂交制种的，特点是种子种下去的植株有杂交优势，但是收获后不能留种。
转基因种子则是先由科研单位通过转基因技术创制出含有外源基因的转基因植物材料，而后这个材料经历农业部规定的各项安全评价后，再通过回交转育的方式来获得含有外源基因且农艺性状较好的转基因自交系，而后这个转基因自交系通过育种的方式找到合适的组合选育出转基因杂交品种。那么转基因种子就这样漫长而愉快的产生了。
2是国产的吗？
目前我们商业化种植的转基因棉花、木瓜和杨树的种子都是国产的。只要有最后“一声令下”，已经有国产转基因种子的转基因抗虫水稻和转植酸酶玉米就可以种植了。但是那一声令下也许就在不久的将来。理解大多数国人希望国产的愿望，但是民众的盲从与质疑将会使国产转基因种子“夭折”。
3下一代能做种子吗？
其实第一条里已经说了。下一代能否做种子是和制种的方式有关的。只要用的是杂交种，无论是非转基因杂交种子（杂交水稻）还是转基因杂交种子（转基因抗虫杂交水稻）都不能留种。若是自交系制种（小麦），那么不管是非转基因小麦还是转基因小麦则都可以留种。
4粮种被外国公司控制了怎么办 ?
若这样，那么种业被垄断后的高额利润就会被别人赚走，农民的种子投入会被加高，国内的种业公司会濒临破产或兼并，最终可能会危害国家的粮食安全战略。所以，需要提高我们种业研发投入、扶持本国的种业企业。当然，为了让国内的种业有危机感从而提振其研发和市场推广能力，留部分种业竞争空间是必要的。不然，国内的种业行业没有竞争危机感靠保护和扶持来生存，那么最终还是会危害国家粮食安全。
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