新科技快速指南系列之“基因編輯 CRISPR”:歷史、現在與未來

新科技快速指南系列之“基因编辑 CRISPR”:历史、现在与未来

如果你問“Crispr 是什麼?”簡單來說,這是一種革命性的新型分子工具,科學家們可以利用它精確定位和切割任何種類的遺傳物質。Crispr系統是科學家們用來操縱地球上任何生物(包括人類)的生命密碼的最快、最簡單和最便宜的方法。

複雜點來說, Crispr 代表的是集群的定期間隔式的重複。Crispr系統由具有序列剪切能力的蛋白質和遺傳GPS導航組成。這種系統在細菌王國中自然進化出來,作為記憶和防禦入侵病毒的一種方式。但是研究人員最近發現,他們可以重新利用原始免疫系統來精確地改變基因組,從而引發數十億美元的DNA黑客熱潮。

在短期內,Crispr不會結束疾病、飢餓或氣候變化。也許永遠不會。設計者也不會改變孩子的基因或犯下基因滅絕罪。(但開始談論如此強大的技術可能帶來的倫理困境,永遠不會太早。)然而,Crispr 已經開始以更不激進的方式重塑我們周圍的物理世界,一次一個鹼基對。

CRISPR的歷史

這是從酸奶開始的。為了製造酸奶,乳製品生產商長期以來一直使用嗜熱鏈球菌( streptoccus thermophilus )來提供幫助。嗜熱鏈球菌是一種吞噬牛奶中乳糖並排出乳酸的細菌。然而,直到2005年,一位名叫魯道夫·巴蘭古(Rodolphe Barrangou)的年輕微生物學家才發現,嗜熱鏈球菌中含有奇怪的重複DNA序列片段——Crisprs,這些序列保證了嗜熱鏈球菌免受那些能夠導致破壞的病毒的侵襲。(如果嗜熱菌消失了,鼻細菌( nastier bacteria)會進入其中,以乳糖為食,破壞產品。)

不久,杜邦收購了巴蘭古供職的丹麥公司,並開始使用Crispr來保護其所有酸奶和乾酪培養物。由於杜邦擁有全球乳製品市場50 %的份額,這意味著你可能已經在比薩上吃到過經Crispr優化的奶酪了。

與此同時,基因測序的成本直線下降,世界各地的科學家正在組裝細菌的基因組。正如他們所做的那樣,他們發現Crisprs隨處可見——超過一半的細菌王國都有Crisprs。通常,這些序列的兩側是一組編碼的一類稱為內切核酸酶的切鏈酶的基因。科學家懷疑它們參與了這種原始的免疫系統,但究竟是怎麼回事?

關鍵的洞察力來自於一種特別令人討厭的病菌,它能引起喉嚨不舒服。它的Crispr系統產生了兩個RNA序列,這兩個RNA序列連接到一種稱為Cas9的蛤形內切核酸酶上。就像遺傳GPS一樣,這些序列將酶導向與RNA序列互補的DNA鏈。當它到達那裡時,Cas9改變了形狀,抓住 DNA 並將其切成兩半。做出這一發現的分子生物學家詹妮弗·杜德納(Jennifer Doudna )和艾曼紐·夏彭蒂爾(Emmanuelle Charpentier)在2012年與《科學》雜誌上發表了他們關於細菌的研究成果。但在將這一技術作為基因工程的一種工具獲得專利之前,這一點是不可能實現的。如果你切換RNA導航,你就可以把Cas9送到任何地方——比如說,把引起亨廷頓舞蹈病的基因剪下來。他們意識到,Crispr將是分子生物學家的曲速引擎。

CRISPR的未來

就目前而言,Crispr仍然是生物學家的流行語。但是就像計算機從一個乏味的、專門為數學愛好者設計的工具演變成了我們身體無處不在的、無形的延伸一樣,Crispr總有一天會無縫地編織到我們現實的結構中。如果這只是一個生物性的問題,問題很容易就能解決。

以工業發酵為例。在老式基因工程技術的幫助下,科學家們已經將大腸桿菌和啤酒酵母等微生物,重新編程到可以生產從胰島素到乙醇等各種物質的工廠中。Crispr將迅速擴大生物精煉廠所能生產的設計化學品、分子和材料的目錄。自癒合混凝土?耐火、以植物為基礎、比鋁還輕的建築材料?完全可生物降解的塑料?Crispr不僅使所有這些成為可能,也使大規模生產它們成為可能。

Crispr技術的民主化,加上其幾乎無限的商業可能性,使得今天是成為一名分子生物學家的絕佳時機。想要製造只針對有害細菌而不消滅整個微生物群的抗生素嗎?有些公司正在這樣做。想要製作醫生可以用來檢測登革熱和寨卡病等疾病的紙質診斷嗎?也有研究實驗室和創業公司正在這樣做。隨著更多工具上線,後端Crispr生態系統將不斷擴展以支持、提供和優化這些工具。

診斷疾病

病毒的工作原理是把你的細胞變成它們DNA的小工廠。一個基於Crispr的測試可以從一滴血、一口唾沫或一滴尿液中提取出外源DNA,並在幾分鐘內告訴你你體內是否有寨卡病毒、登革熱或黃熱病。

農作物抗病

每年,真菌消滅了三分之一的農作物。Crispr可以找出最嚴重的“違規者”,這有助於農民在農作物發生枯萎病發生之前挽救收成。

對抗抗生素的耐藥性

由於過度使用,世界上的抗生素正在失去效力。以Crispr為基礎的新藥物,只針對有害細菌,可以保持微生物群完整,有助於對抗抗生素耐藥性。

原文鏈接:https://www.wired.com/story/wired-guide-to-crispr


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