上一季講到，地球少女夏安安在夥伴們的幫助下成功集齊了50位精靈王的力量，並且得到了終極精靈王不滅冷的允許，集齊所有精靈們的力量，開啟了花之法典。在與黑暗魔神最後的決鬥中，花之法典中的神秘力量起了決定性的作用，邪惡的黑暗魔神再一次被封印。
從此，花仙世界再次恢復了往日的平靜。勤勞的仙子們正在為重建家園而努力著，守護女神夏安安和古靈之王庫魯魯攜手憧憬著美好的未來。
然而潛在的危機並沒有解除，大魔法師愛德文和戴薇薇發現，花仙世界的結界處，產生了傳說中的時空裂縫。大量的異時空能量擁向花仙世界，撼動的花仙世界的本源結界。雖然本源結界經過歷代守護花神加強，但是抵禦強大的黑暗魔神，學界早已破損不堪，瀕臨崩塌。這一集結果讓眾人很是擔心，總有更大的變故降臨。
經過上一次的仙魔大戰，安琪兒女神因為與黑暗魔神交手後，女神的身體早已孱弱不堪，已經沒有能力再次加強花仙結界。黑暗魔神利用曾經潛藏在穆回體內的暗黑種子從而復活，重新掌控勿忘我精靈王穆回的身體，快速吸收著溢進花仙世界的異時空能量積蓄力量。
重新復活後的黑暗魔神，在吸收了異時空能量後，實力更甚從前。這次重新歸來的它帶著無窮的怒火，發誓要抽取花仙世界的本源，摧毀所有的花仙生命。
古靈仙族之王庫庫魯，因為之前有被黑化的經歷，體內暗藏的黑暗種子發作了，重新被黑化了。由於庫庫魯本身實力的加強，再加之黑暗魔神力量的改造，庫庫魯成為黑暗魔神旗下的超一流戰士。因為庫庫魯是安琪兒女神的軟肋，所以黑暗魔神派他作為先鋒奪取花仙世界和女神的性命。
對於黑暗魔神的由來，說法眾多。有人說黑暗魔神來自花仙世界的異空間，可以吸收異時空能量。還有說黑暗魔神來自於人們的黑暗心靈之中，不死不滅。不管怎樣，黑暗魔神都是一位極其頭疼難纏的對手。
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