我們都知道，這次事件的由頭與馮小剛、劉震雲有關，在范冰冰與馮小剛早年合作的電影《手機》中，葛優扮演的的男主角疑似影射了主持人崔永元，電影中的該角色出軌劈腿，最後自食其果的故事，極大影響了崔永元的事業和職業上升。
劉震雲，是《手機1》的著作人，尤其是原本打算邀請崔永元出演，崔老師拒絕後，還用心去幫助他們出主意，結果電影出來，劇中影射到崔老師的角色是因為出軌下屬而離職。後來劉震雲是跟他道歉了三次，事也就這樣過去了。《手機2》出來之前崔問過劉希望三思，劉說不會，名字叫《朋友圈》，但海報出來還是《手機2》，崔徹底怒了。
崔永元爆料央視一位主持人在採訪完某藝術家後，罵其“這傻×今天真配合”。2005年，崔永元在一次接受採訪時說：“我們臺一個主持 人在做談話節目，採訪一位藝術家，這個藝術家很投入，很忘情，主持人也在現場號召大家向他學習。 這個主持人出來後卻說‘這傻×今天真配合’……我看這個節目時，他(那個主持人)在哭，我就嘔吐。”當時他沒有指出這名主持人是誰，公眾猜測 該話影射朱軍。後來向朱軍及家人鞠躬致歉。
崔永元和方舟子兩人因“轉基因之爭”開始辯論，隨後上升到質疑對方語言邏輯問題、有無資格科普等。辯論升級為鬧劇，方崔互相問候家人。隨後雙方都起訴對方。2015.海濱法院公開宣判：雙方均構成名譽侵權，互賠4.5萬元。相互道歉，刪除侵權微博。
而因為和方舟子互懟，崔永元的朋友同時也是方舟子朋友司馬南，因為支持方舟子而遭到崔永元的怒懟，崔永元頻繁指責司馬南“造謠”
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