在池塘養魚中，往往產生大量的有害藻類，造成水體質量惡化，影響魚的生長，甚至引起魚中毒死亡，可使池塘養殖經濟效益降低15%～20%。現將養殖池塘中幾種主要害藻的綜合防除技術介紹如下。
一、水綿、雙星藻、轉板藻
多在天氣轉暖後，在魚池淺水處萌發，長成縷縷細絲，底端紮在池底，上端直立水中，故也稱深水性絲狀植物。當其衰老時斷離池底，漂浮水中，形成團團亂絲，魚苗魚種誤入其中往往被纏繞而死。另外，大量的亂絲漂浮在水中，嚴重影響浮游生物對光的吸收和水溫的提高，阻礙氧氣的溶解，並且大量消耗水中的養分，使池水變瘦，影響魚類生長。
放養前用生石灰幹法清塘，每畝用生石灰75公斤。清塘後底質差的池塘每畝施有機肥200～300公斤。水綿等發生後用硫酸銅溶液全池潑灑，使池水中硫酸銅濃度為0.7毫克/升，2天后換1/3新水;
二、水網藻
俗稱綠絲毛藻，多發生在較肥的淺水魚池中，因其藻體結集後形如網帶，所以幼小的魚苗誤入網中很難復出，被網住的魚苗因呼吸和攝食困難而死亡。
放養前用生石灰幹法清塘，每畝用生石灰75公斤。如水網藻發生，潑灑硫酸銅使池水硫酸銅溶液為15毫克/升濃度殺滅，潑灑面積為池塘面積的1/5。
三、銅綠微囊藻、水花微囊藻
俗稱湖靛、銅鏽水，多在高溼季節發生，特別是在水溫28～30℃、pH值8.0～9.5時生長最快，而此時也是魚類生長較快的季節。其危害有兩方面：一是當藻類大量死亡後，其本身含有的蛋白質迅速分解，併產生羥胺(NH2OH)及硫化氫(H2S)等有害物質，這些物質達到一定濃度後，魚類就會大量死亡，特別是對上層肥水魚類的危害更為嚴重;二是當其生長過盛時，水中溶氧不足而引起魚大量死亡，使池水缺氧更趨嚴重，這種現象多發生在半夜至清晨池水本身溶氧量最少時，所以極易引起魚類缺氧死亡。
放養前池底每畝施基肥500～1000公斤，使池水保持一定肥度;高溫季節經常換新水;有條件的可配養一定數量的羅非魚。
如發生湖靛，用硫酸銅溶液全池潑灑，使池水硫酸銅濃度為0.7毫克/升;亦可在發生初期每畝養羅非魚1000尾。
四、多甲藻、裸甲藻
俗稱紅水，多發生在含有機質多、硬度大、呈微鹼性的高溫水體中，它們對環境變化非常敏感，如當水溫和pH值突然改變時，就會大量死亡。它們死亡後產生甲藻毒素，這種毒素會使魚中毒死亡。所以在溫度變化較大的季節應特別警惕。
發生前經常更換新水，調節水質，破壞其發生環境。發生後每畝用生石灰15公斤，以提高池水的pH值，突然改變其水生環境，使之死亡，然後換新水衝除死亡藻類;亦可用硫酸銅溶液全池潑灑使池水硫酸銅濃度為0.7毫克/升，2天后換1/3新水。
五、小三毛金藻
它能分泌一種使魚中樞神經中毒的毒素致魚死亡。在養殖水體中，小三毛金藻的數量超過3000萬個/升，水呈黃褐色時，就會引起鰱、鱅、鯉等魚大量死亡。
發生前施有機肥和磷肥，培肥池水，使有益藻類為優勢種群;放養後經常注意水的肥度，最好使池水保持25釐米的透明度。
發生後用新水換出金藻蔓生的池水，然後用磷肥和糞肥調節水質;潑灑硫酸銅使池水硫酸銅濃度為0.7毫克/升，抑制金藻分泌毒素，然後更換新水。
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