眾多周知，日本軟銀這幾年一直都是阿里巴巴的最大股東。所以呢，總有人問阿里的控制權到底在中國人還是在日本人手裡。對此，有坊間傳言：阿里巴巴第一大股東是日本的軟銀，軟銀的第一大股東是南非標準銀行，南非標準銀行的第一股東是中國工商銀行，中國工商銀行的第一股東是財政部。
一方面，當前日本軟銀持股28.8%，仍是阿里的最大股東。另一方面，網店轉讓服務商易佰店發現，馬雲對阿里的持股在一步步減少：2018年7月，馬雲對阿里的持股比例為6.4%；2017年6月，馬雲對阿里的持股比例為7%；2016年5月，馬雲對阿里的持股比例為7.8%……而阿里在2014年上市時，馬雲持股8.9%，日本軟銀持股34.4%。
那麼這一變化，最大受益者是日本軟銀嗎？並不是！要知道，馬雲、蔡崇信曾與軟銀達成協議，軟銀不得在沒馬雲、蔡崇信同意情況下撤掉任何由阿里巴巴合夥人制度遞交的集團董事，並需將超過30%的投票權投向馬雲和蔡崇信。這一次持股比例下降後，蔡崇信持股比例減少為2.3%，如果將馬雲、蔡崇信視為一個整體，又獲得軟銀所持有的投票權，馬雲實際投票權超過37.5%（6.4%+2.3%+28.8%）。可以說，目前馬雲仍牢固掌控阿里集團控制權。
雖然持股下降，但並不影響馬雲通過阿里高管來控制阿里巴巴集團。除上述原因之外，還有以下幾個原因：其一，阿里要求合夥人必須持有公司一定股份，合夥人要在60歲時退休或在離開阿里巴巴時退出合夥人（永久合夥人除外），而永久合夥人只有馬雲和蔡崇信。其二，阿里採取AB股的二元股權架構，即公司創始人和高管持B類股票，投資人持A類股票，B類股票每股表決權等於A類股票10股的表決權。馬雲及管理層合計表決權約為63％。其三，董事提名權，合夥人會議的主要權利體現在董事候選人的提名權上，不是按持股比例分配的。阿里合夥人擁有提名50％以上董事候選人的專有權。
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