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深入研究分析表明，杂交后代群体羽色分化由单个基因决定，完全符合孟德尔遗传定律。正是由于一个6.6 kb的大片段序列插入到MITF基因中，导致其负责黑色素合成的转录本被完全抑制表达，黑色素合成途径被关闭，从而形成了北京鸭洁白的羽毛。更重要的是，该研究鉴定出导致北京鸭体格变大的主效基因IGF2BP1，在相同饲养时间内，该突变型可以多增加15%的体重，同时饲料转化率提高6%。该基因原来是在胚胎期发挥促进生长作用，而北京鸭在被选育过程中，其远程增强子上产生了一个自然突变，致使该基因在北京鸭出壳后仍持续表达，饲料利用效率的提高致使其体格变大。
研究表明，IGF2BP1这一调控体格大小的通路和方式在各类畜禽中广泛存在，可将这一远程变异调控IGF2BP1持续表达的机制引入其它品种乃至其他畜禽，为进行其他畜禽品种改良提供了可能性。此项研究从方法论角度为系统解析动植物品种改良机制提供了经典范例，并为畜禽分子育种提供了理论基础 。
值得一提的是，2013年中国农业大学、爱丁堡大学与华大基因组成的联合研究团队在Nature Genetics上发布了鸭基因组测序工程，并揭示其多项对禽流感产生免疫反应的遗传机制【1】。
据悉，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所周正奎副研究员、西北农林科技大学博士生李鸣、程红、北京畜牧兽医研究所博士生凡文磊、北京林业大学袁峥嵘副教授为共同第一作者，西北农林科技大学姜雨教授和北京畜牧兽医研究所侯水生研究员为共同通讯作者。
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