晨光映入眼簾，體溫和血壓不久後便會上升。
人體會根據腦中視交叉上核(簡稱SCN)所內建的24 小時時鐘來運作。SCN 中的2 萬個神經細胞位於眼睛後上方、下視丘前端的腦區。這些細胞是人體的主時鐘，負責設定睡眠、覺醒、進食及分泌荷爾蒙的節律。
取自SCN 的細胞即便在試管內仍會按時運作，它們滿載轉錄因子，會按24 小時的週期來調節其他分子的製造量。主要的轉錄因子為BMAL 及CLOCK，兩者會協力促成周期分子和隱花色素分子的生成。當兩種分子的濃度增加時，便會反饋給BMAL 及CLOCK，好讓上述分子停止生成。這些分子的量因此會週期性地升降，形成精準生理時鐘的基礎。
SCN 也可能太快或太慢，因此每天都得藉著日光重設或校準。位於眼睛後方的自主感光視神經細胞(一種感光細胞)負責前述工作。當這些細胞察覺光線時，並不會製造影像，而是以名為視網膜下視丘路徑的神經組織將信號傳至SCN，使主時鐘同步，接著再向其他部位報時。
6:45血壓上升
晨光映入眼簾，將信號送至SCN，以重設生理時鐘。體溫和血壓不久後便會上升。
7:30停止製造褪黑激素
SCN 會傳送信號至松果體，要求停止製造睡眠荷爾蒙(即褪黑激素)。
8:30腸胃蠕動
胃部的排空在夜間會變慢，但人醒來後，腸胃就會開始蠕動。
10:00最有警覺性
睡醒後的體溫會持續上升，在中午前的數小時內，人的思緒最為清晰。
14:30最為協調
吃完午餐的下午時段最易昏昏欲睡，但研究也指出，此時是協調身體活動的最佳時機。
18:30血壓最高
血壓會遵循「杓型模式」：白天上升，夜晚下降。
19:00體溫最高
SCN負責調節體溫，以協助生理時鐘的其他部分維持同步。體溫在晚間最高。
21:00開始製造褪黑激素
夜幕降臨，睡眠荷爾蒙開始釋出，持續整晚直到日出。
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