所謂的菌肥，亦稱生物肥、生物肥料、細菌肥料或接種劑等。
菌肥，形象說來就是“菌+肥”，因為菌肥一方面含有“有機質、氮、磷、鉀”等作物生長所必需的營養成分，同時產品中還含有大量的有益微生物菌，有益微生物菌在土壤中繁殖，起到改良土壤、防治病害等功能。
菌肥是近年來經常見到的肥料之一，在農業生產中經常見到，在我國菌肥近年來發展較快。
菌肥是微生物肥料的俗稱，它是一種帶活菌體的輔助性肥料。
土壤中存在著大量的微生物（包括細菌、真菌、放線菌），一般每克土含有幾億至幾十億個微生物。
人們用科學的方法從土壤中分離、選育有益微生物，經過培養、繁殖、製成菌劑，將這些菌劑應用於農業，使作物增產，稱為菌肥，又叫做微生物肥料。
目前我國生產和應用的菌肥主要有根瘤菌、固氮菌、磷細菌、鉀細菌、抗生菌肥料等。
菌肥是通過有益微生物的生命活動，拮抗有害微生物，促進土壤中養分的轉化，提高土壤養分的有效性，改善作物營養條件，增加土壤肥力。
施用菌肥有菌液葉面噴施、菌液種子噴施、拌種和固體菌劑與種子拌和作為菌肥等。
菌肥怎樣起作用？
菌肥的主要作用，是由活菌決定的。
活菌通過自己的活動，分解土壤裡的營養物質變成植物可以吸收的養分，分泌一些對植物生長有用的物質，也有有效菌死去之後留下的物質。
具體每一種活性菌有自己主要的作用，不是一種活性菌具備以下所有的作用。
一、對土壤的作用：
增加營養元素的有效含量、減少化肥施用，增加有機肥效果。
二、對植物的作用：
幫助植物吸收營養、刺激植物生長，增加植物抗逆性、讓植物長得更好。
三、對有害生物的作用：
防治有害生物，增加抗病性。
（一）對土壤的作用
1.對土壤的作用
植物無機態的營養就是一些離子，化肥溶於水由分子態變成離子態，植物好吸收，因為它帶電荷，利於植物吸附。有機態的營養是好多原子在一起組成的大分子，不太容易被吸收，菌肥的作用是把有機態的氮磷鉀變成無機態的，利於植物吸收。
增加氮元素的菌有三種，就是把空氣中的氮元素合成植物能吸收的那種。
1根瘤菌 2自生固氮菌 3 聯合固氮菌
能增加有效鉀含量的是鉀細菌，也叫硅酸鹽細菌。
一般認為這些細菌可以通過分泌酸，溶解硅鋁酸鹽類礦物，釋放鉀素營養，這些營養能供給植物也能給自己用，當細菌死後，體內富含的鉀會釋放出來，產生的激素、氨基酸會促進植物生長，抑制其他病原菌生長。
1.對植物的作用
幫助植物吸收營養、刺激植物生長，增強抗逆性。
菌根菌劑，主要是VA菌根，也叫從枝狀菌根。它們也是跟植物根系在一起的，但是不像根瘤菌，它們把根插到植物根裡，自己再長出一些根毛樣的東西，協助植物吸收養分。
2.對有害生物的作用
防治有害生物，增加抗病性。
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