在某個著名微胖文化人口中，鄭芝龍、鄭成功父子和王直都是倭寇，他們手下都有日本人，鄭成功還有日本血統，都同日本有著商貿往來。這個說法能把鄭芝龍從墳墓裡氣詐屍，因為鄭芝龍即使是在名聲最差時也只是被人叫做閩盜、海賊，他最不想要的名號就是倭寇，最不想要讓人把他同王直聯繫在一起。
鄭芝龍和王直最大的區別在於鄭芝龍是紮根於福建的海商、海賊（當時全世界老老實實不犯法的海商比大熊貓還少），福建有很多人受惠於他；而王直是倭寇的中國合夥人，王直的貿易最大的受益者是日本。王直隊伍中的作戰骨幹就是日本浪人，在1552年攻克黃岩縣城戰鬥中，王直帶領的萬餘倭寇中真倭有3000多人。王直還是日本最大的硝石和火繩槍的供應商，是日本進入火器時代的“功臣”。
在王直等人率領的倭寇隊伍不但淫掠婦女，他們還把善於織造絲綢的女子專門挑出來進行奴隸勞動，對中國的紡織業是重大威脅。最重要的一點是王直公開殺死過明朝地方官吏，有過招安後反水的前科。明朝人自然知道王直等人的隊伍裡假倭居多，對王直等人的定義是“諸奸畏官兵搜捕，亦遂勾引島夷及海中巨盜，所在劫掠，乘汛登岸，動以倭寇為名，其實真倭無幾”。
鄭芝龍的求招安策略最大的特點就是給官府面子，在老鄉中求得一個相對較好的名聲。他的隊伍中強調“禁淫殺” 、“不許擄婦女、屠人民、縱火焚燒、榨艾稻穀”；還劫富濟貧，“所到地方，但令報水，而未嘗殺人。有徹貧者，且以錢米與之”；對官兵很給面子，“不攻城堡、不害敗將”、“舍（洪）先春不追，獲盧遊擊（毓英）不殺。又自舊鎮進至中左所，督帥俞諮皋戰敗，縱之走。中左人開城門求不殺，芝龍約束麾下，竟不侵擾”。鄭芝龍的行為極大保全了明朝官吏的面子，為以後的招安提供了前提。
其次鄭芝龍是泉州老鄉眼中的能人，是能帶著泉州人發家致富的領頭人，贏得了泉州士紳的擁戴,“芝龍盡以海利交通朝貴，寖以大顯”。明清時期的中國地域、族群之間矛盾非常激烈，不光福建人經常和廣東人因為食物問題開打（這真不是廣東人要吃福建人，而是兩者在很多生意上有爭端，福建人和廣東人壟斷著東南亞、海南等地的不同行當），福建人內部競爭對外貿易中漳州人和泉州人也是老對頭，在鄭芝龍崛起以前擁有月港的漳州人對泉州人擁有極大優勢（月港是明代後期官方公認的外貿港口，有“天子南庫”的美稱）。
鄭芝龍因此有針對性的提出了 “侵漳而不侵泉”的口號並付諸實施，在1626年到1628三次進攻、焚燒月港，還把自己佔領的中左所變成了福建對外貿易的窗口，讓老鄉們大發利市。此外他還派兵護送糧船到同安救濟老鄉，在福建出現災荒時出錢出糧讓老鄉們開墾臺灣，贏得了賙濟同鄉的名聲。這樣一個強有力的老鄉自然被泉州士紳們看中，泉州知府就是在當地士紳的公關下提出了招安建議，在鄭芝龍同鍾彬（鍾彬一度帶著了鄭芝龍九成多的部眾、船隻）競爭處於下風時泉州老鄉的支持也至關重要。
明朝史書中對鄭芝龍家族的評價是“八閩以鄭氏為長城”,鄭芝龍就算是巨賊也是地道的福建泉州產，是福建海商中的頂級大佬。連名聲譭譽參半的鄭芝龍都不是倭寇，更不用說日本人都尊稱為國姓爺的鄭成功了。
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