1949年9月25日、26日，西北邊陲連傳佳音：陶峙嶽、包爾漢在毛澤東的親自謀劃和張治中的影響下，經過新疆進步力量的積極推動，利用解放軍大軍壓境的有利形勢，戰勝各種反動勢力的重重阻撓，經過驚心動魄的一次次鬥爭，率領全疆8萬國民黨官兵和新疆省國民黨政府毅然起義，全疆160萬平方公里的土地從此獲得解放。
陶峙嶽和包爾漢在起義的電文中稱：“自張將軍離開西北，關內局勢改觀。而張將軍復備致關垂，責以革命大義，囑全軍將士迅速轉向人民民主陣營，俾對國家有所貢獻。”
聞此喜訊，張治中興奮地說：“我一貫保全新疆、保障和平的目的直到今天長時期是如願以償了。今後的新疆將永遠是中國的新疆，新疆人民亦將永遠享受祖國在大家庭的和平、自由、幸福了。回顧從1945年到1949年間，特別是1946年到1948年這三年，新疆局面是如此緊張，人民心理是如此動盪，多少次數瀕於決裂，瀕於戰爭，真使人驚心動魄，寢食不安。好了，現在一切問題都迎刃而解，一切問題都成為過去了！”
促成新疆和平起義，是張治中以新的身份與中國共產黨進行合作的開始。共產黨自然不會忘記張治中在新疆和平解放中所作的貢獻，1955年，毛澤東親自授予張治中一級解放勳章。
新疆和平起義宣佈西北四省全部解放。毛澤東開始考慮西北地區軍政領導的人選問題。期間，毛澤東、周恩來和張治中就新疆的民族自治、改組省政府、軍隊改編、財政、經濟建設以及對蘇條約等一系列重大問題進行討論。事後，張治中還寫了一篇書面報告《新疆概要的問題》，就《新疆地理、歷史與政治改革》、《伊寧事變與和平協定》、《幾個問題和意見》等幾個題目加以敘述，呈送毛澤東，作為最高決策的參考材料。於是，毛澤東再次點將，讓張治中去西北工作。
1949年10月，中央人民政府成立，全國劃分為六大行政區,彭德懷任西北軍政委員會主席，張治中任副主席。
命令宣佈後，毛澤東親自接見張治中，客氣而幽默地說：“文白先生，我們再來一次國共合作吧！”
張治中謙遜地說：“今天您是領導，談不上什麼國共合作。不過西北人民和部隊袍澤常常懷念我，我也常常懷念他們，您如認為我有去西北一趟的必要，我願意做彭老總的顧問。”
“你去當彭德懷的副手，委屈了吧？你過去是西北四省的軍政長官，現在是副手，委屈了吧？”原來毛澤東怕張治中有什麼想法，才故意這樣問。
聽毛澤東這麼一說，張治中有些窘迫，連忙說：“哪裡哪裡，我誠意接受，聽命令，聽吩咐。”
毛澤東高興地說：“那就好，那就好！今後你可以來往於西安北京之間。”
張治中欣然應命，表示一定能同彭德懷及西北其他領導人團結合作，共同建設新西北。
11月22日，張治中以西北軍政委員會副主席的身份，飛往蘭州。幾天後，張治中偕同彭德懷飛赴迪化市視察工作。在新疆期間，張治中協助彭德懷，為成立新疆軍區、改組新疆省政府和穩定起義部隊做了大量有益的工作。張治中還親自對起義部隊的各級將領和機關幹部以《怎樣改造》和《再談怎樣改造》為題目，作了兩次重要講話，進行思想教育，對新疆起義部隊以至對全國的起義部隊都起到了很好的作用。
12月28日，張治中隨彭德懷飛回蘭州，隨即去西安，成立西北軍政委員會，協助彭德懷開始陝、甘、寧、青、新五省的領導工作。這一時期，張治中與彭德懷團結合作，為西北地區的穩定做出了重要貢獻。
毛澤東對張治中西北之行所作的工作表示滿意，當面稱讚道：“國共合作得很好嗎！”（人民網）
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