孵化是肉鴨生產中的重要環節，種鴨蛋孵化工作的好壞，不僅直接影響到種蛋的利用率、出雛率和雛鴨質量，而且還關係到後來的育雛成活率、雛鴨生長速度，乃至整個飼養過程的經濟效益和生產技術水平的發揮。因此，創造適宜的孵化條件，滿足種蛋胚胎髮育的要求，對獲得好的孵化效果，對肉鴨的發展具有巨大的作用。
不同的肉鴨種類其孵化期的長短也略有差異。一般來講，鴨蛋的孵化期為28d;番鴨蛋的孵化期為33~ 35d。胚胎在體外的發育過程主要受孵化條件的影響，這些孵化條件主要指溫度、溼度、通風、翻蛋和晾蛋等。
①溫度應根據胚胎的需溫特點、入孵方式和孵化方法正確供溫分批入孵時採用恆溫孵化法，孵化機的溫度為37.4~ 37.6'C,出雛機溫度為37.0~ 37.2C:整批入孵時採用變溫孵化法，1~7d孵化溫度為38C，8~ 12d為37.8C，13~ 18d為37.6C，19~ 25d為37.3C，26 ~ 28d為37.0C，孵化室室溫最好控制在22 ~ 26'C。在實際工作中，應根據孵化器的實際使用情況以及不同季節適當調整孵化溫度，以達到理想的孵化效果。
②溼度一般遵循“兩頭高，中間低”的原則。孵化初期(1~ 12d)，胚胎產生羊水和尿囊液， 並從空氣中吸收一些水蒸氣，還要使胚胎受熱均勻，溼度控制在60% ~ 70%。孵化中期(13 ~ 24d),胚胎要排出羊水和尿囊液，因此，應降低溼度到55% ~ 60%為宜。孵化後期(25 ~ 28d), 有適當的水分可與空氣中的二氧化碳結合產生碳酸，使蛋殼中的主要成分碳酸鈣變為碳酸氫鈣而變脆變軟，有利於雛鴨破殼，並防止蛋殼膜和蛋白膜過分乾燥粘連以及雛鴨絨毛粘殼，溼度應控制在65% ~ 75%為宜。在孵化過程中，若溼度過低蛋內水分蒸發較快，胚胎易與蛋殼膜粘連，影響正常出殼。若溼度過高蛋內水分不易蒸發，影響胚胎的發育，出殼的雛鴨出現水腫、“大肚”、跗關節紅腫等現象。
③通風一般要求孵化器內氧氣含量不能低於20%，二氧化碳含量不得超過0.5%。如果超過1%~ 1.5%,胚胎髮育遲緩，死亡率高，弱雛增加。含氧量在21%時，每減少1%，孵化率大約下降5%。孵化器中的二氧化碳水平超過0.5%會使孵化率下降，含量達到1%時則顯著降低，當達到5%~10%時則完全致死。通風過度則會影響到溫度和溼度，雛鴨出現眼睛閉合，眼部絨毛粘連，脫水，糞便呈綠色等。通風的要領是按胚齡大小，開啟通氣孔。將孵化全程分成3期，前期開1/4~ 1/3，中期開1/3~ 1/2，後期全開。如分批孵化，孵化機內有兩批以上的蛋，而外界氣溫不是很低，可以全部打開通氣孔。
④翻蛋目的在於改變胚胎的方位，使各部位受熱均勻，避免胚胎與蛋殼粘連，有助於胚胎的運動，以保證胎位正常。鴨胚28d發育期間，只需要前期1~ 25d進行翻蛋，要求每2h翻蛋1次，翻蛋角度90，以水平位後仰或左右各45”為宜，並要防止震動。翻蛋動作要輕、穩、慢。
⑤晾蛋可將 蛋內產生的多餘的熱散失掉。孵化後期，由於胚胎的代謝率提高，自身產熱能力增強，使蛋內的溫度急劇升高，若不能散失，將會影響胚胎髮育。因此，到孵化的14~ 16d後開始晾蛋，以每天晾2~ 4次為宜，一般用眼皮試溫，感覺既不發燙又不發涼即可放到孵化機內，直至出雛。前期晾的次數少，時間短;後期次數增加，時間延長。其方法是打開機門，將蛋盤抽出，或將蛋車拉出，讓其自然冷卻。夏天外界的氣溫較高，只採用通風晾蛋不能解決問題，可將25 ~ 30C的水噴灑在蛋面上，表面見有露珠即可，以達到降溫目的，如果噴1次水不能解決問題，可噴2次，以縮短晾蛋的時間。晾蛋時間不能太長，否則易使胚蛋長期處於低溫，影響胚胎的生長髮育，必須根據具體情況，靈活應用。還可切斷加熱電源，只開風扇。每次晾至蛋表面溫度達到35C時可繼續孵化。
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