BIORXIV论文显示马来穿山甲为新冠病毒潜在重要宿主

2020年2月18日发布在生物学预印服务的一篇文章《中国南部马来穿山甲中2019-nCoV相关冠状病毒的鉴定》给出研究成果表明马来穿山甲所携带的冠状病毒与新冠病毒高度相似。论文作者单位包括汕头大学和香港大学病毒学联合研究所、北京化工大学生命科学与技术学院、广西医科大学生命科学研究所、悉尼大学等,管轶为通讯作者。


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Biorxiv


bioRxiv(发音为“bio-archive”)是一个免费的在线档案和分发服务,用于生命科学中未发表的预印本。它由冷泉港实验室运营,这是一个非营利性的研究和教育机构。通过在bioRxiv上发布预印本,作者能够立即向科学界提供他们的发现,并在将稿件提交给期刊之前收到有关草稿的反馈。为生物学家专有的预印本文献库,已超过3.3万篇文章。


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《中国南部马来穿山甲中2019-nCoV相关冠状病毒的鉴定》(译名)

文章研究的穿山甲样本是2017-2018年广西海关和2019年3月广州海关在反走私行动中获得的,来源地可能是东南亚地区。其中广州海关的样本穿山甲冠状病毒基因组与2019-nCoV有大约85.5%至92.4%的相似性,而2019-nCoV在受体结合域中与广东穿山甲冠状病毒表现出非常高的序列相似性(RBD; 97.4%氨基酸相似性)。另根据蝙蝠冠状病毒与新冠病毒有96%的相似性,文章列出了病毒发育的分析树,其中包括中华菊头蝠、中菊头蝠与马来穿山甲冠状病毒的关系。认为马来穿山甲是新冠病毒的重要潜在宿主。详情见图片。(包括摘要和部分论文原文及翻译、部分图表,翻译为Google翻译调整,译文如有不当敬请谅解。原文网址https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.13.945485v1)


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系统发育分析描述了人2019-nCoV,本研究中获得的穿山甲冠状病毒序列与其他参考冠状病毒之间的进化关系


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序列比对显示人,穿山甲和蝙蝠冠状病毒中的受体结合域(RBD)

联系到2月7日华南农大发布的消息,虽然一般的报道没有具体说明来源,但据此农大的样本应该也是来自海关缉私查获的马来穿山甲,并且农大研究样本的“分离的病毒株与目前感染人的毒株序列相似度高达99%”,另外农大样本的且中华穿山甲中没有检出。BIORXIV这篇文章所指的“中国南方”“广东”“广西”并非表明这批马来穿山甲来自本地,而可能是境外的东南亚地区。也并不意味着病人是本地感染的,目前患者应该还是源于武汉居留史。那么是否走私的马来穿山甲流到武汉市场才导致的疫情爆发呢?目前还不清楚兽-人传播的方式。而这里也明确了,武汉华南海鲜市场在关闭的时候有关动物类货物已经被清理掉了,这其实表明了在防控疫情之初的调查程序不严谨,没有及时保留市场野生动物样本。


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马来穿山甲 Manis javanica © Dan Challender



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