中药材既是原料药又是成品药，是用于防治疾病或保健的特殊商品，因此中药材安全无污染非常重要。但是在中药材引种栽培及贮存运输过程中，往往遭受到各种病虫害的为害直接影响其产量和质量。
目前防治中药材病虫害主要依靠化学农药。
由于长期使用化学农药，造成许多严重的副作用，如农药在中药材中的残留问题，害虫的抗药性问题，流水、土壤等环境污染问题；并且由于中药的质量主要取决于它的有效成分的含量，过量施用农药或施用农药不当，不但使中药材中农药残留超过允许的标准，而且致使中药材有效成分含量降低。
伴随我国加入WTO以及中药材市场和国际接轨，中药材的质量越来越重要，农药残留量超标等直接影响到中药材进入国际市场。实施无公害中药材生产，对于创品牌，提高中药材产品的市场竞争力，推动中药材产业的持续健康发展，增加药农收益有着十分重要的意义。近年来，由于中药材生产中农药、化肥的超量使用，造成中药材产品中农药残留、硝酸盐及重金属等有害物质大量积累，严重影响到人民群众的身体健康。因此，中药材生产必须向无公害方向发展。
无公害中药材生产不仅对灌溉用水、周边环境以及农药的使用有严格要求，还对施用化肥的种类、用量等有严格的限制，以确保中药材中硝酸盐及其他有害物质的含量不超标。无公害是一个相对的概念，由于药材生长在自然环境中，一点没有污染的环境几乎是不存在的，不进行病虫害防治、不施农药的药材是极少的；为了丰产，完全不施化肥的药材也微乎其微。
要想绝对的无污染、无公害是不现实的。
为了适应目前的生产形势，考虑到人体的适应能力，各国都制订了有关标准，目前，公认的无公害药材实际是商品药材中不含有某些规定不准含有的有毒物质，或把它控制在允许的范围内，即农药残留不超标；硝酸盐含量不超标；工业废水、废气、废渣等有害物质不超标；病原微生物等有害物不超标等
综上所述，无公害中药材属无公害食品范畴，也必须遵循无公害食品生产的原则。实现中药材无公害生产的目标，将为国民经济和人们的医疗保健做出巨大贡献。
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