论文注释的规范化是学术论文规范的重要组成部分，因为学术论文的引证不仅是学术规范化的重要内容，也是学者伦的重要方面。论文的注释包括对学术论文中正文以外不同部分的解释和说明，根据注释说明的对象和功能的不同，一般可分为题目注释、作者注释、引文注释和释义性注释四类，下面主要针对引文注释中存在的一些问题进行探讨。
规范的注释不仅为读者对相关问题进行更深入的研究提供研讨的线索，也为科研评价与文献工作提供了重要的依据。同时，它也在一定程度上反映了学者本人的学风、学术品格和功底。比如，有的文章在该注释的地方没有注释，或者注释不完全；有引用著作的名称却不标页码；有的注释有误，依其所注查不到相应的引文；有的明明是转引别人的文章或著作中的外文注释，但并不注明所转引的出处；还有的注释原本是源于外文书刊，但作者却翻译成中文，令人无从查阅。
也有些作者的文章虽然从表面上看似乎做了注释，而且做得很规范，但仔细一看，就发现在文章中阐述作者最主要论点的部分，大段地引用了别人的著作，却偏偏没有注释。事实上，像这种在次要的地方注释很认真，而在重要的、关键的地方有意不做注，对注释有意遗漏问题并非罕见。这里，注释仅仅被作为一种形式，而在这种注释形式化的背后，暴露出作者缺乏尊重他人成果的学术意识，甚至在一定程度上与抄袭剽窃有联系。
在外文注释中，最常见的问题就是相当一部分作者引用别人论著中的二手材料，且不与原始材料核对，以至于出现书名与作者名不附，张冠李戴，页码不准确的问题。因此，一个规范的注释最好不要采用“转引自”，认真的作者不应满足于“转引自”，而应该找到最终的出处。
我们应当大力倡导“诚实做注、诚实引证”的学术道德。中国的学术界其实也是有很多有思想、有见解的学问家的，但他们却总是得不到社会的承认，甚至往往被埋没。一个重要原因是，他们的思想、见解发表出来，在引起社会广泛注意之前，先就通过被有意不做注的“引用”而变成了引用者的东西。而引用者将其思想攫为己有以后，却可能利用做学问以外的手段来扩大自己的影响，借猎取别人的成果而成了名家。学术道德规范是一个科学态度问题，研究者要加强学术自律，要尊重别人的学术成果。
还有一个值得注意的问题是，有的文章注释虽然很全，其所引用的资料来源均是英、法、德、日等国的报刊，再仔细一查，你可以发现这些五花八门的注释都来自一个出处，这就是新华社的。鉴于这些资料的全部内容都可在网上查到并下载，因此需要注意有人利用这些资料内容通过块操作拼凑论文的可能性。
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