03.06 人類、豬、小鼠大腦中的蛋白編碼基因圖譜發表

科技日報記者劉傳書

美國時間3月5日,由卡羅林斯卡學院、瑞典皇家理工學院和華大等團隊共同完成的一項題目為“人類、豬、小鼠大腦中的蛋白編碼基因圖譜”的研究發表於Science(影響因子41)。該研究基於多種轉錄組學方法和抗體圖譜技術,對大腦不同區域進行了全面、深入的分子解析,並且提供了高質量的蛋白編碼基因的分子圖譜,為進一步研究提供了有力的武器。

人類、豬、小鼠大腦中的蛋白編碼基因圖譜發表

大腦是哺乳動物體內最複雜的器官,具有多種多樣的生理機能,錯綜複雜的細胞結構以及極為豐富的基因表達。在不同腦區、細胞和亞細胞層面鑑定大腦的分子構成,必將推進我們對正常和患病狀態下大腦功能的認識和理解。

專家介紹,人類蛋白圖譜(HPA)是一個大規模研究項目,旨在結合轉錄組學與蛋白組學,探索不同細胞、組織和器官的轉錄本和蛋白質的空間表達水平。目前,HPA下的組織圖譜僅僅包含有限的幾個人類大腦區域(大腦皮層、海馬、尾狀核和小腦)的數據。正因如此,我們迫切需要更加深入的研究,從而增進對於中樞神經系統的細胞動力學背後複雜的分子過程的理解。

人類、豬、小鼠大腦中的蛋白編碼基因圖譜發表

圖為三個物種不同腦區的基因表達特徵

該研究成功地構建了哺乳動物大腦的基因圖譜,是對現有的若干個大腦圖譜項目的重要補充。為了確定大腦在不同系統發育順序上的差異和相似性,研究涵蓋了三個物種的表達譜:靈長類動物(人),偶蹄目(豬)和齧齒目動物(小鼠)。研究的重要部分之一是將蛋白圖譜和轉錄組數據相結合,對小鼠大腦多個區域的特定蛋白進行了深入研究。所有數據——包括高分辨率圖像和元數據——全部公開以便後續研究。

人類大腦圖譜的構建,將為全世界研究者提供更為豐富的數據資源,以利於對哺乳動物大腦的基因組學研究和進一步探索。

該研究基於華大智造MGISEQ-2000和BGISEQ-500測序平臺完成。


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