是年，清兵擄掠河北、山東，但山海關始終無法攻入，明軍勤王部隊，已經抵達，清兵退。李自成自去歲敗於官兵，元氣大傷，後官兵被調入京勤王，李自成得以喘息，躲藏於山中修養。張獻忠降而復叛，湖北被其攪亂，招撫張獻忠的熊文燦被下獄問罪。
清軍退
1638年秋，皇太極大舉對明朝用兵，所到之處燒殺擄掠，深入千餘里，擄掠人口四十餘萬，銀錢近百萬兩，1639年三月，清兵帶著掠奪的人口金銀，向北退去。
原本就風雨飄搖的大明帝國，經過清兵這一次的破壞，更加雪上加霜，皇太極通過一次次劫掠，留下大片的殘垣斷壁，殘民傷病等待救治，這麼做，還調動了明朝內地的軍事力量，讓原本圍剿義軍的部隊，不得不北上勤王。
許多人也許要問，皇太極可以兩次三番深入進來，為什麼不直接打下北京城？
皇太極怎麼考慮的我們不知道，也無法知道，我們試著找找原因，其一，當時的明朝還有很多忠於崇禎的軍隊和將領，皇太極如果想要一城一城的打下來，代價不小，即便打下來，還要分兵駐守，那麼在兵力不充足的情況下，很可能會被人數眾多的大明軍隊各個擊破，要知道，人口是皇太極最大的劣勢。
其二，皇太極要想進北京城，可是要比李自成難一些，因為皇太極是外族入侵，李自成屬於起義造反，所以，當幾年後，李自成打到北京城下的時候，城裡就有人給李自成開城門，雖然後來，李自成被多爾袞打敗，倉皇逃走，多爾袞用的理由是，幫崇禎復仇，剿滅李自成，雖然這種說法很可笑，但是，在當時的情況之下，還真讓多爾袞順利平定天下，由此可見，師出有名有多重要。
張獻忠叛亂
原本已經投降熊文燦的張獻忠，在明軍被抽調北上勤王的時候，受到的壓力，也小了很多，原本，張獻忠就不打算真的投降，這點，左良玉看出來了，但是，熊文燦沒看出來。
張獻忠的出爾反爾，將原本已經受到遏制的亂局，再次重新攪亂，熊文燦也被下獄問責，而楊嗣昌留下的十面網，也變得四處透風，成了一張破網。
張獻忠的復叛，得到了羅汝才（曹操）等人的響應，讓義軍重新看到了生存的希望，張獻忠在出其不意之下，打敗了左良玉，等官兵反應過來，張獻忠已經快到了四川，再想圍出一張網，就不容易了。
因為熊文燦接納張獻忠投降的緣故，讓楊嗣昌也受到了牽連，雖然沒有很大的變故，但是，崇禎帝對他也沒之前那般信任。
1639年，內亂再次突發，加之外敵入侵，兩相計較之下，明朝損失不小，優秀的將領先後死去，精銳的部隊越來越少。
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