在1948年之後，由於鐵托領導下的南斯拉夫聯邦奉行“鐵托主義”，拒絕服從由蘇聯的莫斯科發佈的命令，因此蘇聯和南斯拉夫之間產生重大的分裂。在這種情況下，新生的南斯拉夫人民軍（JNA）發現自己無法獲得新型的武器裝備，無法更新自己老舊的二戰裝備。1950年，西方國家向南斯拉夫伸出了橄欖枝。1951年南斯拉夫軍事代表團訪問了美國，達成了一項軍事援助協定。根據這份協定，南斯拉夫被納入了MDAP（國防部援助計劃），1951年-1958年，JNA在上世紀50年代得到了多種裝甲車輛，其中就包括了M36“傑克遜”坦克殲擊車。
南斯拉夫人民軍裝備的M36坦克殲擊車。注意旁邊的人民軍士兵使用的是繳獲的德式裝備。
1953年-1957年，JNA共得到了399輛M36坦克殲擊車，這些M36替代了此前在JNA中服役的蘇聯SU76自行火炮，執行反坦克和遠程火力支援任務。由於當時南斯拉夫與蘇聯的關係較為緊張，因此首批裝備M36的部隊是守衛南斯拉夫東部邊界，以防止蘇聯發動進攻。幸運的是，這種攻擊從未發生過。
閱兵式上的南斯拉夫M36坦克殲擊車，車身上的標語意為“十一月大選萬歲”
南斯拉夫通過對M36的測試發現，M36裝備的90mm主炮的火力較為強大，可以有效的對抗T-34/85坦克，但是面對T-54/55這類新一代坦克時，這門主炮的威力就有些不足。到了1957年，南斯拉夫人認為M36的火力已經無法應對當時的新型坦克，因此計劃將其用於支援步兵作戰。1959年之後，M36從JNA的步兵團中逐步撤裝，但是仍然在很多部隊中使用。到了60年代後期，M36開始逐步退出一線作戰部隊，改為執行訓練任務。70年代後，部分M36加裝了9M14“薩格爾”反坦克導彈，改為反坦克導彈發射車使用。儘管JNA在80年代開啟了大規模的軍事現代化進程，但是由於先進武器數量不足，M36仍然在使用。
由於M36在JNA中服役的時間很長，因此在服役期間，M36經過多次改裝測試。在一部分M36上，JNA測試了紅外夜視儀，這一系統直接取自M47“巴頓”坦克，於1962年開始進行測試，1963年正式投產。在70年代，由於M36原裝的福特發動機已經嚴重老化，因此JNA為M36換裝了T-55上裝備的B-2柴油機。由於蘇聯柴油機的體積較大，因此M36的發動機艙進行了修改，將排氣管移到了車輛的左側，並換裝了一個大尺寸的開門，安裝了全新的空氣和機油濾清器。
從退役的M36上拆除的B-2柴油機。
儘管M36在90年代初已經完全過時，但是當南斯拉夫內戰爆發的時候，由於裝甲力量嚴重不足，幾乎所有的現役M36都參加了戰鬥。由於南斯拉夫的解體，開戰之初M36在波斯尼亞、斯洛文尼亞和克羅地亞都有相當數量的存在，分別被多個勢力所控制。
南斯拉夫內戰期間，幾乎所有戰車上都塗有標語。這輛M36的炮塔上標記著“憤怒的姨媽（БјеснаСтрина）”，車身後部噴塗著“逃跑，叔叔（Бјежи Ујо）”的標語。“叔叔”是克羅地亞語Ustashe的塞爾維亞諷刺名字。在這輛戰車的炮塔右上角，寫著“Mица”，這是女性的名字。
在南斯拉夫內戰期間，大部分裝甲車輛都主要用於為步兵提供火力支援，因此儘管M36已經老舊，但是依然可以發揮作用。在南斯拉夫的山區，M36的靈活性使其得到了步兵們的歡迎。在南斯拉夫內戰期間，M36主要以單獨形式或者少量車輛編組，來為步兵提供火力支援。
在戰爭期間，部分M36車上加裝了橡膠履帶裙板，試圖增強其對RPG火箭彈的防護能力。很難說這種改裝是否有效，但是這種改裝似乎有助於車組成員提高其自信心。今天，在英國的達克福德軍事博物館中，我們可以看到一輛進行過這類改裝的車輛。
南斯拉夫內戰中帶有橡膠裙板的M36。
戰爭結束後，由於缺少零部件和過於老舊，大部分M36都已經報廢。波黑在短時間內使用了M36，但是隨後其裝備的M36均退出現役報廢。只有新成立的南斯拉夫聯盟共和國（南聯盟）仍然將其列為現役裝備。根據1995年底簽訂的《代頓協定》，前南斯拉夫的成員國必須減少其裝甲車輛的數量。根據該規定，南聯盟退役了19輛M36。
在1998年的衝突中，一些駐紮在科索沃和梅託西亞的部隊裝備有M36，這些M36與“科索沃解放軍”進行了交火。得益於南聯盟高超的偽裝技術，這些M36在隨後的北約空襲中，損失並不嚴重。
1999年南聯盟從科索沃撤軍時，一輛M36的運輸車和美軍M1A1坦克擦肩而過。
M36的最後一次參戰是在2001年，當時駐南斯拉夫南部地區的M36對當地的阿爾巴尼亞分離主義分子進行了打擊。2003年，隨著南聯盟將國名從“南斯拉夫聯盟共和國”改為“塞爾維亞和黑山”，這批M36的服役時間正式超過了南斯拉夫作為一個統一國家存在的時間。2004年6月，M36的所有使用和訓練都停止，2005年，塞黑軍隊中的M36全部退役完畢，進行報廢處理，結束了其在南斯拉夫近60年的服役經歷。
目前，一些M36還在前南斯拉夫地區各個國家的各種軍事博物館和軍營中展出，還有一些出售給國外私人收藏家。
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