在神秘的西遊記當中，最為神秘的並非烏巢禪師。烏巢禪師雖神秘，可出場次數不多，出場時長卻不長，西遊記整本書洋洋灑灑寫了七八十萬字，但描寫介紹烏巢禪師的文字僅僅用去幾百字。
而相比之下，菩提祖師則不相同。西遊記本書共計一百個章節，但卻有約略一個章節，描寫敘說的是菩提祖師。可見，菩提祖師是大人物，吳承恩用了大手筆介紹祖師。但祖師的真身究竟是誰？誰人又能告訴我呢？
究於菩提祖師之神秘難測的身份，故有了許多“專家”紛紛前來研究祖師。有人說，他為如來佛之化身，這是不現實的，如來佛乃佛教老大，修行的為佛法，可菩提祖師傳授給猴子的是道教法術，有人可能會說，如來佛牛叉啊！一邊主修佛法另一邊又兼職學習道教法術不行嗎？行！但佛教的如來若能在學好佛法的同時又能將道法發揚光大，教出一個能鬧天宮的弟子來，那他如來佛是真夠牛叉的。若真如此，那如來佛背後的故事，可就多了。
所以，貿然說菩提祖師之真身為如來佛祖，這是完全不現實的。
有人說，菩提祖師這麼牛叉，教給孫悟空道教法術，那他肯定是太上老君的化身咯！可別忘了，老君是道教的祖師爺，道教都是老君發明的，純粹的道教人士，怎能會給猴子取出一個“孫悟空”的名字來呢？“悟”這可是純粹的佛門語言。
所以，太上老君也不可能是菩提祖師。
那，菩提祖師到底是誰呢？他為啥神秘地出現一次卻又再也不見了呢？其實，吳承恩先生早在幾百前年便猜透了諸位的心思，知曉在幾百年後有人如筆者一般，會來思索，這個菩提祖師是誰？所以，吳承恩早在書中給出了答案。
大覺金仙沒垢姿，西方妙相祖菩提……與天同壽莊嚴體，歷劫明心大法師。
記得原著中，有這樣的一句話。從中能提取出三個名字。皆為菩提祖師所有。
祖菩提，明心大法師，大覺金仙。
可見，這個傳授給孫猴法藝的菩提祖師乃大覺金仙，並且他是菩提祖，又為明心大法師！這段文字中的這三個屬於菩提祖師的名字，可就有著大問題了！一個為大覺金仙（道教），又是明心大法師與祖菩提（佛教儒教），可見菩提祖師完全是一個釋儒道三家都精通的大人物。
所以，菩提祖師的真身顯然不會是如來更非太上老君。
那他又是誰呢？其實，將菩提祖師的這三個名字組合起來，結合他的洞府對聯“靈臺方寸山，斜月三星洞”，便可知：菩提祖師乃孫悟空的心頭之師。
因為，孫悟空先前是道教弟子，可成佛後的他卻成了佛門弟子，差不多的情況下，孫悟空與菩提祖師是一模一樣的，既精通道法，又精通佛法；而孫悟空又是“心猿”，菩提祖師則是“菩提（意為心之智慧）”這在某種情況下，皆是相通的。
所以，解釋來解釋去，菩提祖師並非遠在天邊的神秘人物，他非如來更非老君亦非其他人物，他其實一直存在孫悟空的心中，乃猴子之心頭之師。
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