（一）主要病害防治
1．花椒的主要病害有葉鏽病、幹腐病、炭疽病、枯梢病。
防治措施：一是加強管理，提高樹體抗病能力；二是清除病源，減少傳染源；三是發芽前噴40%福美砷100倍液或5o石硫合劑，可以起到預防保護作用；四是從6月份起，用70%甲基託布津可溼性粉劑800倍～1000倍液、50%退菌特800倍液、0.3o～0.5o石硫合劑等藥劑每10天～15天噴1次，上述藥劑可以交替使用。
2．腳腐病：是一種根莖和根部的病害，幼樹、成年樹均受害發病。病部呈現黃褐色至黑褐色，根皮腐爛常流出褐黃膠液，病部可這木質部。溫媛溼潤時，病部迅速向縱橫擴展，引起主幹、主根和側根、鬚根腐爛，減弱樹勢，甚至導致死亡。此病主要由於椒地積水、施用未腐熟肥料或挖培土時傷根過多引起。所以，要以農業防治法為主，搞好排水清除積水降低溼度；要施腐熟肥料，培士時注意不要傷害樹根，以免造成傷口而感染病菌。發病後可用1:1:10波爾多液或2%硫酸銅溶液灌根部2～3次，每次間隔5～7天。
3．花椒膏藥病
症狀主要危害花椒的主幹及枝，不論幼、中、老齡樹均易發生該病。危害初期樹皮出現灰色斑點，以後病斑中部逐步轉為褐色。病斑由灰褐色的菌絲重疊交錯形成，並不斷擴大，最後在表層形成一大圓形厚膜。
防治方法：①用小刀或竹片颳去菌膜，然後塗上石灰漿或石硫合劑的渣液。②冬季落葉至翌年發葉前，用波美5度的石硫合劑噴樹。
（二）主要蟲害防治
1．花椒蚜蟲防治 危害嫩枝梢、幼芽、花等，嚴重時可造成花椒提前落葉，少結椒或不結椒，樹勢生長減弱。花椒樹發芽前，用40%氧化樂果乳油2000倍~4000倍液噴灑全樹，殺死越冬卵。4月上旬，樹幹塗40%氧化樂果乳油15倍液，樹盤內撒施2.5%樂果粉、辛硫磷顆粒劑，淺耙入土，殺滅根部蚜蟲。
2．棉粉介殼蟲 在花椒樹發芽前用速撲殺、介殼靈、介霸等藥劑噴霧防治，效果良好。
3．天牛 主要以幼蟲危害枝幹，枝幹受害後易遭風折、腐爛，甚至整枝枯死。人工捅殺初齡幼蟲及成蟲。6月～8月份在樹幹塗白防止成蟲產卵。生長季節發現有新鮮排糞孔，用薰蒸毒籤插入蟲孔防治，或向蟲孔注射氧化樂果、敵敵畏等藥劑，然後再用黃泥封死蟲孔。
4．黃鳳碟
以幼蟲取食嫩葉。可採取人工捕捉，嚴重時可用敵百蟲、馬拉松乳劑1000倍液噴殺。
5．黑絨金龜子
以幼蟲啃食根莖以下的皮層使植株死亡。可用75辛硫磷或90%晶體敵百蟲1000倍液澆灌根部殺死害蟲。
6．金花蟲的成蟲、幼蟲
均可危害花椒的嫩芽、花葉。可用90%晶體敵蟲600～800倍液噴灑防治。
7．花椒草履蚧
該蟲一年發生1代，經卵和初孵化若蟲在樹幹基部土壤裡越冬。3月下旬若蟲上樹危害，4月上中旬危害加重。是花椒生產的大敵之一。近年來給花椒生產帶來了嚴重威脅，大發作年份可造成大幅度減產或絕收。3月底至4月初花椒樹發芽顯蕾時正值若蟲上樹期，此時可用40%樂果乳油1000～1500倍液配等量消抗液，及時淋洗或噴布花椒樹全株，防治效果最佳。
8．桔齧跳甲防治
除越冬防治外，在5月中、下旬成蟲交配產卵期，用50%的對硫磷乳油或40%氧化樂果乳油1 500倍液噴冠，毒殺成蟲和卵，防止初孵幼蟲潛入葉內為害。7月中、下旬當第一代成蟲出現時，應進行第二次噴冠。
9．芳香木蠹蛾
成蟲發生期，在主幹一米以下塗白，防止成蟲產卵。塗白劑的配製是：生石灰5公斤、硫磺0.5公斤、水20公斤，配合成液刷在主幹上。小幼蟲期用石頭砧蟲害部位，可砧死大部分幼蟲。
10．鑽蛀性害蟲
據調查統計，花椒鑽蛀性害蟲有30多種：臺灣狹天牛、二斑黑絨天牛、黃帶球虎天牛、花椒窄吉丁、小蠢科的小蠢蟲、炸蟬、大青葉蟬、柳木蠢蛾、散白蟻等。不同害蟲鑽蛀方式和鑽蛀部位不同，有在樹幹和樹枝的木質部為害，有在韌皮部為害，有在表皮下為害，有在樹的根基部和莖基部為害。
可採用3種方法：一是插磷化鋁毒籤，在樹幹上發現新鮮排糞孔，插一個毒籤，防治效果100%；二是發現新鮮排糞孔後注射50%1605乳油10倍液，殺蟲效果也達100%；三是磷化鋁薰蒸法，方法是在樹幹上發現蟲孔較多時，用塑料薄膜把樹幹包起來，合縫口用膠紙貼住，在塑料和樹幹之間投入0. 5-1片磷化鋁片，上部用繩子把塑料薄膜和樹幹緊緊捆在一起，並用泥巴塗上一圈，下部把塑料薄膜用土埋實，以防漏氣。一週後調查，幼蟲死蟲率也達100%。
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