巴尔的摩病毒分类系统

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对所有病毒来说,生成细胞能识别的mRNA(信使RNA)至关重要,因为mRNA所携带的信息能够直接指导蛋白质合成。


戴维·巴尔的摩(David Baltimore)是1975年诺贝尔生理学或医学奖得主。他根据病毒的基因组产生mRNA的方式,将“千奇百怪”的病毒分为7组。


这些分类涉及4个主要的概念:链的方向(正/负链)、链的数量(单/双链)、核酸类型(DNA/RNA),以及逆转录

如果简单理解,DNA和RNA都是由碱基排列而成,这些碱基链都是有方向性的。在双链结构中,碱基会按照互补原则配对,因此如果确定了其中一条链的序列,另一条链的序列也就随之确定。


我们所说的正链一般指与mRNA顺序一致(相似)的链,而另一条与之互补的就叫负链


遗传信息从DNA流动到RNA的过程被称为转录,而相反,有一些病毒会把这个过程反过来,用RNA“倒推”DNA,这个过程就是逆转录


I

双链DNA病毒


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双链DNA病毒拥有双链DNA作为遗传物质,其病毒周期可以被简单概括为:它们利用宿主细胞的聚合酶转录出mRNA,再通过mRNA翻译出所需的蛋白,并利用DNA聚合酶复制出子代DNA,这样就组装成完整的新病毒。


代表病毒:腺病毒、疱疹病毒


II

单链DNA病毒


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单链DNA病毒可以有正链或负链的DNA单链,简单来说,其步骤和双链DNA病毒有些类似,但“加”了一个步骤,他们要先生成双链DNA作为中间体,然后再转录出mRNA,并进一步翻译、组装。


代表病毒:细小病毒、猪圆环病毒


III

双链RNA病毒


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RNA病毒与DNA病毒利用的遗传物质不同,因此和DNA病毒相比,它们有一个显著特点:这类病毒一般会在自己的遗传物质中“藏”着RNA复制酶(也叫依赖于RNA的RNA聚合酶,RdRp)的信息,这些酶能以RNA为模板复制出RNA。


在生物细胞中,RNA通常以单链形式存在,但在有些病毒中,也时常能看到RNA以互补双链的形式出现。它们一般在进入细胞时会直接带着一些RdRp,通过这种酶和自身的负链生成细胞可识别的mRNA,进而翻译出蛋白,并复制出子代的双链,最后组装成完整的子代病毒。


代表病毒:轮状病毒、呼肠孤病毒


IV

正链单链RNA病毒


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正链单链RNA病毒((+)ssRNA)带有的是与mRNA方向一致的正链,因此这些正链在前期可以直接充当mRNA的角色,翻译出相关的蛋白,而后也可以用负链RNA作为中间体,产生新的正链作为mRNA和遗传物质。


代表病毒:冠状病毒、丙肝病毒


V

负链单链RNA病毒


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负链单链RNA病毒((-)ssRNA)的过程相对更“直接”,它们可以通过负链和RNA复制酶直接生成mRNA。


代表病毒:埃博拉病毒、马尔堡病毒


VI

单链RNA逆转录病毒


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下面两类病毒被称为逆转录病毒,这一大类病毒在增殖时有一个显著特点,它们带有特殊的逆转录酶,会用RNA逆转录出DNA。其中一类是以单链RNA为遗传物质(ssRNA-RT),它们会先将自身单链RNA逆转录成单链DNA,随后细胞会把单链补成双链,这就生成了前病毒的双链DNA病毒基因组。这些双链DNA会被整合进宿主细胞的基因组中,从而“肆无忌惮”地被表达和翻译出来。


代表病毒:HIV、人类T淋巴细胞病毒


VII

双链DNA逆转录病毒


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最后这类逆转录病毒看似“不合理”,但确实存在。它们自身拥有双链DNA作为遗传物质,但在增殖时还需要RNA作为中间媒介参与,并涉及逆转录的过程。


代表病毒:花椰菜花叶病毒、乙肝病毒


图片来源:Sara Confalonieri/Wikicommons

长图图片来源:Thomas Splettstoesser,QuteMol,Graham Beards,Scientific Animations,BruceBlaus/Wikicommons


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