稅務稽查依法對納稅人的納稅行為進行監督檢查，促進其履行納稅義務，它是稅收徵管工作的“
最後一道重要防線”。國家稅務總局稽查局根據稽查工作任務和計劃，按照計劃有序、依次安排的原則，每年按行業隨機選取重點稽查對象組織開展檢查，原則上每五年檢查一輪。省、市稅務局稽查局根據本級稽查工作任務和計劃，有序選取重點稽查對象開展檢查，原則上每五年檢查一輪。對非重點稽查對象中的企業納稅人，每年抽查比例不超過3%；對非重點稽查對象中的非企業納稅人，每年抽查比例不超過1%。三年內已被抽查的隨機抽查對象，不列入隨機抽查範圍。那麼，納稅人為何會被稅務稽查呢？是什麼事項引起了稅務機關的關注以至於被稽查呢？
1、申報表和附表表際關係有問題
不論是增值稅還是所得稅，最基本的問題是企業的納稅申報表之間的勾稽關係填報是否準備完整。不要草草填完了事，要多檢查幾遍。其實很多時候稅局也是從企業的申報表裡面發現企業有問題的。
2、進項銷項發票比對出問題
在金三以前，稅局就對增值稅進項和銷項進行大規模的審核了，主要是審核發票內容是否一致、稅率準不準確，光是內容不一致就讓很多向鑽空子的商貿企業納稅人麻煩了。
3、增值稅零申報
零申報是很多企業偷稅的常用手段，長期零申報存在很大的隱患，如果持續半年以上零申報，稅局就會對企業進行業務分析調查，看看是不是又存在隱匿收入的可能。
4、稅負率異常
每個地區的稅務系統對於各個行業的增值稅、所得稅的平均稅負水平有記錄，如果是在平均稅負上下20%左右波動可能還不會引起關注，但是如果變動太大，稅局會展開納稅評估，調查是什麼原因造成這種差異的。不正常稅負率一向是稅務稽查的重點，所以要引起重視。
5、開票內容和數量存在差異
每個月稅局都會對納稅人使用的發票種類、數量和領用存情況進行審核，購領發票數量是不是符合實際用量進行審核。
發票增量贈版都是比較困難的，因為之前在黑的那個發票用量和版次的時候就已調查過你的企業情況了，一旦你突然提出加量加版，稅局會實地去核實你的企業情況，現在嚴打虛開發票的，稅務管控力度加大。
6、稅收優惠不是隨便享受的
對於享受稅收優惠政策的企業，特別是雙軟企業認定、高新認定等，稅局每年都會專門進行清查。
7、購買農產品發票抵扣
免稅農場品是虛開發票的一大源頭，因為農業合作社之類的農業生產者自產自銷農產品免稅，但免稅的農產品可以給下游採購上開具收購發票或銷售發票計算抵扣進項稅，這樣很多企業會鑽這個空子，虛開發票。
這裡要提醒一下，現在國家對虛開農產品發票查的很嚴，一旦敢在農產品發票上做手腳，後果嚴重。
8、重點稅源企業隨時準備檢查
對於重點稅源企業，一向是稅局重點關注對象，畢竟納稅大戶一家的納稅量就得多少中小企業才能抵得上，所以這類企業出現偷稅漏稅損失也更大，所以隨時都會有稅局來檢查。
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