重慶市五屆人大常委會第十六次會議批准設立重慶市兩江地區人民檢察院，其主要職責是辦理長江干流和嘉陵江流域重慶境內發生的跨區域生態環境和資源保護領域行政公益訴訟案件。
重慶兩江地區人民檢察院是重慶市人民檢察院的派出機構，與重慶鐵路運輸檢察院合署辦公，暫保持重慶鐵路檢察院現有領導職數、人員編制、內設機構不變。
設立方案顯示，重慶兩江地區人民檢察院的主要職責為：在重慶鐵路運輸檢察院原有案件管轄範圍基礎上，賦予重慶市兩江地區人民檢察院兩類案件管轄權，一是長江流域重慶境內發生的跨區域生態環境和資源保護領域行政公益訴訟案件，二是長江流域重慶境內發生的不適宜地方檢察機關管轄的生態環境和資源保護領域行政公益訴訟案件。
據瞭解，2019年重慶檢察機關深入開展保護“長江母親河”公益訴訟專項行動，共立案生態環境公益訴訟1588件，同比上升35.4%，提出訴前檢察建議1363件，提起公益訴訟52件。督促治理被汙染水域、被損毀耕地、林地等6900畝，督促清理固體廢物、生活垃圾等近5萬噸，追償生態環境修復費用1050萬元。
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