摘要
由於潰瘍性結腸炎(UC)相關性大腸癌(CRC)和散發性大腸癌在臨床表現和分子特徵上不同，我們試圖評估DNA甲基化對基因表達影響的差異。
研究結果
圖1：按組織表型區分的甲基化位點。
a)顯示每次比較之間重疊甲基化位點數量的維恩圖。
b)熱圖表示UC相關結腸癌和鄰近的非發育不良UC組織之間的無監督分級聚類。
c)表示散發性結直腸癌和相鄰正常組織之間無監督分級聚類的熱圖。
圖2：全基因組轉錄分析區分UC和散發性結腸癌。
使用RNA測序數據進行主成分分析，比較A)UC-結腸癌、UC癌鄰近的非發育不良組織、散發性結腸癌和散發性結腸癌鄰近的正常組織；B)UC相關的結腸癌和鄰近的非發育不良UC組織；以及C)散發性結腸癌和鄰近的正常組織。
d)與散發性結腸癌相比，IBD癌症中的GAGE通路顯著豐富。
e)維恩圖顯示UC相關結腸癌與炎症活躍的鄰近組織和UC相關的結腸癌相比，與鄰近組織中無炎症(靜止)的相比，差異表達基因的數目。
圖3：潰瘍性結腸炎患者中DNA甲基化和RNA轉錄本表達呈反向關係的基因。
相關圖顯示了y軸上的轉錄表達和x軸上包含18個基因的32個位點的歸一化DNA甲基化值，這些基因在UC癌和癌旁組織中的轉錄表達有顯著差異(p值<0.05)，甲基化與表達呈顯著負相關(p值<0.05)。藍色三角形代表加州大學相關結腸癌的組織，紅色圓圈代表鄰近非發育不良粘膜的組織。
圖4：ANPEP、FAM92A和STK31在UC相關癌中的表達。
用針對A)ANPEP、B)FAM92A和C)STK31的抗體在正常對照組、UC相關結腸癌和結腸癌旁UC組織中進行免疫組織化學染色。UC相關癌症和鄰近的非增生組織的代表性圖像以10倍的放大倍數拍攝，插圖以40倍的倍率放大。
結論
DNA甲基化對轉錄物表達的調節涉及到結腸癌發生的關鍵基因，這可能解釋了IBD和散發性結腸癌在表現和預後上的不同。
DOI：10.1093/ecco-jcc/jjz014
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