目前工程進度款結算方式主要有以下兩種
（1）按月結算：施工單位按月申報工作量及價款，業主進行審核與支付。
（2）分段結算：即按形象進度付款，按照工程形象進度，劃分不同階段支付工程進度款。
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支付進度款時
首先要求進度款所對應的形象進度或工程量要由業主、監理、施工單位三方確認及對此部分通過驗收合格。
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工程進度款結算時
要如實反映現場實際完成的情況，嚴格扣除未施工項目及預付款、甲供材（按照預算含量）、水電費、質保金、其他代扣代繳費用。
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對採用工程量清單計價的要注意
有些清單子目內含有好幾個子項（工作內容），這就會出現有部分子項已完成、部分子項沒有完成的現象，這就要求扣除此部分的價款或根據經驗按比例支付，只能付少不能多，否則可能會造成超付的現象（這點很容易被忽略）。
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進度款審核的時間控制
如果合同沒有約定的話，要切記收到施工單位報告後14天內未核實完工程量，從第15天起，施工單位報告的工程量即視為被確認，作為工程價款支付的依據。
三、工程結算審核
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收集、整理資料
包括施工合同、投標文件、工程竣工圖、設計變更單、工程簽證、材料調價認價單及其它一些影響工程結算的資料（如工期、質量、文明的確認資料）等。
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合同的模式
（1）固定總價合同 ，如建廠項目的汙水處理項目，這類合同為總價包死，除非設計變更及合同另有約定外，一律不予調整，結算價＝合同價＋變更＋簽證。
（2）固定單價合同，雙方在合同中約定了綜合單價和風險範圍、風險費用的計算方法，在約定的風險範圍內綜合單價不再調整，工程量按實結算。但如果結算工程量超過了合同清單內工程量的一定幅度，則原合同綜合單價另需確定。
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計價模式
（1）工料單價法，是指以分部分項工程量的單價為直接費。直接費以人工、材料、機械的消耗量及其相應價格確定。間接費、利潤、稅金按照有關規定另行計算。
（2）綜合單價法，是指分部分項工程量的單價為全費用單價。
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一些容易忽視價款的扣除
（1）變更增新需扣舊，例如：某辦公樓地下室防水材料發生變更，原設計為地下室外牆作瀝青油氈卷材防水，變更為柔性氯化聚乙稀橡塑共混防水卷材。該項變更的計算應為：計取新材料的費用，扣減原來材料的費用。
（2）超用甲供材價款的扣除，施工單位使用甲供材原則上必須提前上報計劃，經監理與業主審核後供貨，供貨量要嚴格控制，防止施工單位超用或挪用，在結算的時候，用甲供材實際供應量比較相應結算工程量，如甲供材量少於結算工程量，按照甲供材量確定結算工程量，如甲供材量超出結算工程量，則對超出部分進行扣款。
（3）合同價及投標價中措施費的扣除，合同價款的組成中會有若干措施費用，如果在施工過程中施工單位沒有出現其中的一些措施項目，此部分費用在結算時予以扣除。
（4）現場安全文明措施費的扣除，其它項目費用中往往會約定現場安全文明施工措施費獲市級或省級文明工地獎勵費，但如果實際上項目沒有達到獎勵要求，則此部分費用需扣除。
（5）其它費用的計算以是否符合雙方簽訂的工程合同或投標文件中的有關內容（如工期獎、搶工費、優良獎等）計算。
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